Detection of genetic relationships among four Artemia species using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD)   总被引：4，自引：0，他引：4  

Yi Sun  Yi-Cheng Zhong  Wen-Qin Song  Run-Sheng Zhang  Rui-Yang Chen 《International Journal of Salt Lake Research》1999,8(2):139-147

We have applied the technique of random amplification of polymorphic DNA (RAPD) to the analysis of the relationships among four species of brine shrimp: Artemia franciscana, A. urmiana, A. sinica, and A. parthenogenetica. Seventy ten-base synthetic oligonucleotides were used to amplify a total of 458 distinct fragments. DNA polymorphisms were found in all the species examined; the highest percentage of polymorphic bands was found in A. parthenogenetica, with 28.8 per cent. Each species was scored for the presence or absence of every amplification product and the data entered into a binary data matrix. Cluster analysis was then performed to create a dendrogram using UPGMA by the NTSYS program. There are significant differences between bisexual species and parthenogenetic populations. A. parthenogenetica provided 94 specific molecular markers, while bisexual species gave 27 specific molecular markers. A. sinica is a species distinct from the other Old World bisexual species.  相似文献   

贝类种群壳形态性状多态性研究进展   总被引：1，自引：1，他引：0  

刘括  李晓彤  车宗豪  梁腾  方蕾  霍忠明  闫喜武 《海洋科学》2021,45(4):213-221

贝类壳形态具有丰富、复杂的多态性。壳形态作为贝类重要的数量性状是一种环境适应的进化,是不同生理功能适应其生活方式的结果,受环境和遗传因素影响,与贝类的生长、存活、代谢及繁殖等生态、生理行为密切相关。通过贝类可量可数性状建立的壳形态数值分类学方法已在贝类种群形态学比较及群体亲缘关系研究中广泛应用。本文对贝类种群壳形态性状的多态性研究进行了综述,并对壳形态分析方法在贝类种质资源评估（种群识别）及遗传育种（壳宽型/深凹型品系选育）中的应用提出展望,旨在为研究者较全面了解壳形态性状的多态性和分析方法提供参考。  相似文献   

大黄鱼(Larimichthys crocea)ISG15基因单核苷酸多态性及与抗病性状的相关性研究          下载免费PDF全文

李凤欣  殷小龙  卢德政  刘成  张建设  沈斌 《海洋与湖沼》2023,54(1):173-182

由哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)等细菌感染引起的弧菌病对我国大黄鱼(Larimichthys crocea)的养殖造成了严重危害。通过哈维氏弧菌人工感染大黄鱼建立易感组和抗病组,采用PCR扩增和直接测序法对大黄鱼干扰素刺激基因ISG15双拷贝(ISG15-1和ISG15-2)进行单核苷酸多态性(SNPs)检测和分型,并与其哈维氏弧菌抗性进行关联分析。结果表明,从大黄鱼ISG15-1和ISG15-2基因中分别筛选到10个和4个SNP位点并进行了成功分型。经统计分析,ISG15-1基因的186G/C和318C/T位点以及ISG15-2基因的297G/T位点的基因型频率和等位基因频率在易感群体和抗病群体中均存在极显著差异,表明这3个SNP位点与大黄鱼哈维氏弧菌抗性显著相关。连锁不平衡分析结果显示,ISG15-1的SNPs可形成1个单倍块和11种单倍型,而ISG15-2的SNPs可形成1个单倍块和5种单倍型。其中,ISG15-1基因的单倍型H2(CCCCGGTACC)、H6(TCCCACTGTC)和H9(TCCCAGTGCC)与大黄鱼哈维氏弧菌抗性显著相关;ISG15-2基因的单倍型H1(CCCG)和H4(TCCG)与大黄鱼哈维氏弧菌抗性极显著相关。这些ISG15-1和ISG15-2基因的SNP位点以及单倍型可以作为抗哈维氏弧菌病大黄鱼选育的候选分子标记。  相似文献   

三疣梭子蟹低盐适应相关的SNP开发     

冯艳艳  张德宁  吕建建  高保全  李健  刘萍 《海洋学报(英文版)》2019,38(8):41-47

盐度是影响三疣梭子蟹人工繁育非常重要的一个环境因素,抗低盐品系的三疣梭子蟹受到水产养殖界的广泛喜爱。分子标记辅助育种可以大大加快良种选育和性状改良的的过程,目前作为第三代的分子标记技术的SNP,广泛应用到三疣梭子蟹耐低盐品系选育过程中。本实验室已有的研究中,通过不同群体分别在盐度11和33下的基因表达差异,构建的比较转录组学数据中总共包含了615条与低渗调节相关的基因片段。为了发掘三疣梭子蟹与低盐适应相关SNP,本研究基于三疣梭子蟹比较转录组学数据研究结果,筛选出低盐调节相关候选基因片段50条,设计引物进行PCR扩增,共得到总长为18511 bp的DNA片段。通过直接测序法在低盐相关片段上发现了85个SNP位点,分布频率为0.46/100 bp,其中转换突变的比例为81%,颠换突变的比例为19%,转换的比例远远大于颠换,符合“transition bias”原理。C/T或G/A突变所占比例为55%;G/T或C/A比例为26%,A/T突变所占比例为12%,G/C突变比例为7%。通过飞行质谱法,在三疣梭子蟹低盐适应性状分离群体中各成功分型了23个SNP位点。通过卡方检验分析发现,8个SNPs与低盐适应显著相关（P<0.05）。其中有三个关联性SNP位点位于表皮蛋白基因上,有三个SNP位点位于三个新基因上,其他两个SNP位点分别位于水通道蛋白和氯离子通道蛋白基因上。这些标记的开发为三疣梭子蟹耐低盐新品种选育方法的建立奠定了良好的基础。  相似文献   

Microsatellite DNA polymorphisms and the relation with body weight in sea cucumber <Emphasis Type="Italic">Apostichopus japonicus</Emphasis>     

王秀利  单雪  仇雪梅  孟祥盈  常亚青 《中国海洋湖沼学报》2009,27(2):331-336

The relationship between microsatellite polymorphism and body weight of captive bred Chinese sea cucumber Apostichopus japonicus was investigated in two local populations in Dalian. Among ten loci discovered, nine show changes except for AJ07 loci. Seven loci were found highly polymorphic in both populations. For each locus in two populations, the average number of alleles is 6.428 6 and 6.285 7, the average observed heterozygosity at 0.225 7 and 0.245 9, the expected heterozygosity at 0.776 8 and 0.748 8, the polymorphism information content (PIC) at 0.709 2 and 0.674 6, respectively. Further analysis show significant correlation between A. japonicus body weight and occurrence markers AJ02 and AJ04. The findings of the relation may be helpful for molecular breeding, as well as the marker-assisted selection of sea cucumbers. Supported by the National High Technology Research and Development Program of China (863 Program, No. 2006AA10A411), the Natural Science Foundation of Liaoning Province (No.20072139), the Grant of Dalian Fisheries University, the Key Laboratory Foundation of the Educational Department of Liaoning Province (No.2009S024)  相似文献   

三种鳜鱼(Siniperca)生长激素基因内含子多态性的比较研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

刘峰  鲁双庆  刘臻  谢新民  唐建洲  匡刚桥 《海洋与湖沼》2009,40(4):470-478

鳜(Siniperca chuatsi)、大眼鳜(Siniperca kneri)、斑鳜(Siniperca schezeri)为鳜属中3种主要经济鱼类,具有较近的亲缘关系和相似的生活习性,但生长性状差异较大.为探索3种鳜鱼生长差异与基因差异间联系,以野生群体为材料,采用PCR扩增、电泳及测序等方法,对生长发育相关基因生长激素(GH)基因进行了多态性检测与分析.在第一内含子、第二内含子前段、第二内含子中段微卫星序列及第三内含子中均检测到多态性.各区域共检测到25种长度类型,其中4种为鳜与大眼鳜共有长度类型,3种为鳜、大眼鳜与斑鳜共有长度类型,其余18种为各物种特有长度类型.各区域长度类型共组成14种单倍型,无种间共有单倍型.序列长度差异主要由重复序列及DNA片段的插入或缺失形成.在第1内含子3'端-6位与第3内含子5'端+16位各发现一处靠近剪接位点的序列差异.根据多态性检测结果构建系统发育树,鳜与大眼鳜先聚为一枝.本研究可为进一步确认鳜鱼GH基因差异与生长性状间联系,并利用基因差异进行鳜鱼种质资源保护及分子育种奠定基础.  相似文献   

大竹蛏同工酶组织特异性与多态性初步研究   总被引：1，自引：1，他引：1  

张志伟  姚国兴  陈爱华 《海洋科学》2009,33(3):41-43

用不连续垂直聚丙烯酰胺凝胶电泳对大竹蛏(Solen grandis Dunker)外套膜、鳃、性腺、消化腺、斧足5种组织6种同工酶(LDH、ADH、EST、MDH、ACP、SOD)进行组织特异性分析,并对吕四渔场海域大竹蛏自然种群生化遗传多样性进行了初步研究.结果表明:大竹蛏同工酶的活性及酶谱特征具有明显的组织特异性,6种酶在消化腺中的活性最强,LDH、EST、MDH和SOD酶谱具有明显的组织特异性;6种酶在消化腺和斧足中共检测到12个基因位点,其中Ldh-1、Ldh-2、Adh-1、Est-1、Mdh-1、Mdh-2、Mdh-3、Sod-2等8个基因位点为多态,多态位点比例为66.67%,平均每个位点的等位基因数N<,a>为2.5,有效等位基因数(N<,e>)为1.9,预期杂合度(H<,c>)为O.373 7,实际杂合度(H<,o>)为0.333 3,香农信息指数(I)为0.624 2.  相似文献   

Isoenzymes and soluble protein in Arthrospirafrom alkaline lakes in Erdos Plateau, China and in exotic species   总被引：1，自引：0，他引：1  

杨茜栗淑媛  扈瑞平刘燕 乔辰 《中国海洋湖沼学报》2006,24(2):134-141

1 INTRODUCTION Since isoenzyme was first named by Markert and M?ller in 1957 (Hu and Wan, 1985), the separa- tion of isoenzyme has been rapidly developed. Isoenzymes is an important tool for studying life in molecule level. Isoenzymes are transcribed by g…  相似文献   

鸡EX-FABP基因遗传变异及与肌内脂肪含量的相关分析     

张丽  赵志远  杜炳旺  江新生  吴薇薇 《广东海洋大学学报》2011,31(3):75-79

利用PCR-SSCP结合DNA测序方法,对贵妃鸡、怀乡鸡及二者的杂交F1代共计360个个体EX-FABP基因遗传特征及品种差异进行研究,发现2773T>C,2867 C>T和2913 G>A三个位点在贵妃鸡中表现为单态,在怀乡鸡和杂交F1群体中表现为多态,这3个位点有望作为贵妃鸡、怀乡鸡乃致其他品种鸡种质资源鉴定的参考依据。对比分析3个群体胸肌肌内脂肪含量(IMF)表明,怀乡鸡和杂交鸡母鸡的IMF显著高于贵妃鸡;而3个群体公鸡间的IMF差异不显著;除贵妃鸡外,同一品种内公鸡的IMF均小于母鸡(P<0.05)。多态位点与鸡胸肌肌内脂肪含量的相关性分析结果表明,在2773位点,TC基因型个体的IMF值大于TT基因型;在2913位点,AA基因型个体的IMF值大于GG基因型,但没有达到显著水平(P>0.05)。  相似文献   

AFLP analysis of genetic variation among three natural populations of horseshoe crab Tachypleus tridentatus along Chinese coast     

����  �·�  ������  ���ؼ�  ����  �²Ż� 《中国海洋湖沼学报》2011,29(2):284-289

The AFLP(amplified fragment length polymorphism) technique was used to analyze and compare the genetic diversity of Tachypleus tridentatus from three south-eastern coastal sites of China(Pingtan,Hong Kong and Beihai).Eight pairs of primers generated 361 loci,including 285 polymorphic loci.The ratio of polymorphic loci was 96.97%.Nei's genetic diversity index was 0.420 8 and the Shannon information index was 0.607 5,both of which were higher than that reported for many other arthropods.These results show tha...  相似文献