巨蛎属牡蛎DNA序列的比较及鉴定     

彭敏  罗邦  朱威霖  杨春玲  赵永贞  李强勇  刘青云  曾地刚  李旻  陈秀荔 《广东海洋大学学报》2020,(1):29-37

【目的】了解巨砺属牡蛎的系统关系和种类区分。【方法】对我国沿海分布的7种巨砺属牡蛎(香港牡蛎、有明牡蛎、熊本牡蛎、岩牡蛎、艾氏牡蛎、太平洋牡蛎、葡萄牙牡蛎)的线粒体DNA片段(COI、12S、16S和tRNAs),以及核糖体RNA基因转录间隔子序列(ITS-1、ITS-2和ITS)进行分子系统学研究。【结果】无论种间或种内,tRNAs序列差异最大,亚种内TS1序列差异最大;tRNAs和COI序列较其它序列变异更快,种间变异与种内变异之间有明显的条形码间隙;12S、16S、ITS和ITS2的种间变异与种内变异无重叠及条形码间隙;ITS1的种间变异与种内变异出现重叠。在亚种层面,12S、ITS、ITS1和ITS2的亚种间变异与亚种内变异出现重叠;16S的亚种间变异与亚种内变异无重叠及条形码间隙;tRNAs与COI序列亚种间变异与亚种内变异之间有明显的条形码间隙,有利于区分亚种。【结论】tRNAs和COI序列可用于种及亚种的鉴定。  相似文献   

人类首次进入美洲 时间比先前估计晚     

《发现．图形科普》2003,(7):3-3

  相似文献   

日本绒螫蟹放流群体12S rRNA序列研究   总被引：5，自引：2，他引：3  

高天翔  王溪宏  张秀梅 《海洋湖沼通报》2000,(1):47-51

参考果蝇与蚤状溞序列进行了日本绒螯蟹放流群体的线粒体DNA 12S rRNA基因片段的引物设计、PCR扩增及序列测定,得到457bp的碱基序列,其A、T、G、C含量分别为158bp(34.57%)、178bp(38.95%)、51bp(11.16%),70bp(15.32%),与果蝇与蚤状相同基因片段序列含量相似.  相似文献   

环境细菌宏基因组研究及海洋细菌生物活性物质BAC文库筛选   总被引：3，自引：0，他引：3  

杨官品  茅云翔 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(5):718-722

宏基因组是特定环境全部生物遗传物质总和 ,决定生物群体生命现象。特定生物种基因组研究使人们的认识单元实现了从单一基因到基因集合的转变 ,宏基因组研究将使人们摆脱物种界限 ,揭示更高更复杂层次上的生命运动规律。在目前的基因结构功能认识和基因操作技术背景下 ,环境细菌宏基因组成为研究和开发的主要对象。环境细菌宏基因组细菌人工染色体文库筛选和基因系统学分析使研究者能更有效地开发细菌基因资源 ,更深入地洞察环境细菌多样性  相似文献   

中国近海角木叶鲽（Pleuronichthys?cornutus）种群遗传多样性研究     

朱叶  章群  李贵生  刘海林  马奔  黄小彧  司从利 《海洋通报》2012,31(5):552-556

测定了中国沿海角木叶鲽4个群体57个体的线粒体控制区序列,在长度为549 bp的线粒体控制区序列中,检测到3个插入/缺失位点,24个变异位点(包括11个简约信息位点),共出现了37个单倍型,其中9个为共享单倍型。角木叶鲽整体的单倍型多样度(Hd)和核苷酸多态度(P)i结果分别为0.979±0.008和0.00655±0.0037,呈现出高单倍型多样度和低核苷酸多态度分布模式。中性检验结果显示,角木叶鲽种群的Fu’s Fs为显著负值,核苷酸不配对分析呈现单峰分布,表明角木叶鲽在历史上经历过种群扩张事件。群体内个体间的平均遗传距离为0.0065,群体间遗传分化指数都为负值(-0.0067~-0.0460)但不显著(P>0.1),AMOVA分析显示遗传变异主要集中在群体内个体间(102.15%),均表明我国近海角木叶鲽种群无明显的分化,可以作为一个渔业管理单位加以保护和利用。  相似文献   

不同保存条件下中华哲水蚤基因组DNA提取的比较   总被引：4，自引：2，他引：4       下载免费PDF全文

方旅平  林元烧  曹文清 《海洋科学》2005,29(2):1-4

以采自厦门港的中华哲水蚤(Calanus sinicus)为对象，研究多种保存条件对中华哲水蚤基因组DNA提取的影响。结果表明，除5％福尔马林保存的样品没有提取到DNA之外，其余样品均能成功提取出基因组DNA；以该DNA为模板通过相应引物成功扩增出线粒体DNACOI基因片段。其中无水乙醇保存样品提取可靠的基因组DNA方法的建立，为野外样品保存工作提供了一个简便，经济的途径。  相似文献   

Construction of a muscle cDNA library of Chinese shrimp <Emphasis Type="Italic">Fenneropenaeus chinensis</Emphasis> and sequence analysis of the troponin I gene     

Jitao Li  Ping Chen  Jian Li  Ping Liu  Yuying He  Qingyin Wang 《中国海洋大学学报(英文版)》2010,9(1):81-86

A muscle cDNA library of Chinese shrimp (Fenneropenaeus chinensis) was constructed with the SMART™ cDNA Library Construction Kit. The titer of optimal primary library was 7.7×10⁵ pfu mL⁻¹ and that of the amplified library was 3.0×10⁹ pfu mL⁻¹. The percentages of the recombinant clones of primary and amplified libraries were over 98%. The insert sizes were longer than 400 bp with an average of 1000 bp. A positive clone containing a 794 bp insert was sequenced and identified encoding fast skeletal troponin I gene. This library provided a useful resource for the functional genomic research of F. chinensis.  相似文献   

Preliminary analysis of population genetic diversity of cultivated <Emphasis Type="Italic">Laminaria japonica</Emphasis> sporophyte via AFLP technique     

Heng Yi  Zhenghong Sui  Zhenmin Bao 《中国海洋大学学报(英文版)》2010,9(1):53-58

The amplified fragment length polymorphic DNA (AFLP) technique was adopted to estimate the population genetic polymorphism among 30 sporophytes of Laminaria japonica collected from a cultivating farm in Rongcheng, China. Three methods were used for genomic DNA extraction from Laminaria japonica sporophyte and only the products obtained using the improved genomic DNA extraction kit method proved qualified for AFLP analysis. The parameters of the method were optimized. Samples of forty milligrams and the cell lysis time of 120 min were suggested to replace the parameters recommended by the manufacturer. Thirty individuals of Laminaria japonica from the same cultivating site were investigated using one pair of selective primers. A total of 21 loci were obtained and 17 of them were polymorphic. The mean percent age of polymorphic loci of this population was 80.95%. The Nei’s gene diversity (H) within this population was 0.3028 and the average Shannon’s Information index (I) was 0.4498. A genetic distance matrix among different individuals was constructed as well. Through this study, an applicable AFLP genetic analysis working system for Laminaria japonica sporophyte was established. The results of this research also revealed a high level of genetic diversity within the studied population.  相似文献   

基于多位点分子标记和线粒体基因组学中国蚌类(蚌目:蚌超科)物种分类与系统进化研究     

武瑞文  安建梅  陈如如  欧阳珊  吴小平 《湖泊科学》2021,33(6):1788-1804

中国是东亚蚌类（蚌目：蚌超科）物种分布中心,共记录有26属.然而,在世界蚌目框架下,中国仍缺乏一个完整科学的蚌类分类系统.本研究基于多位点分子标记（COI、16S、28S）和线粒体基因组学重构聚焦于蚌超科的蚌目系统发育关系,ML、BI和BEAST系统发育结果均支持蚌科5亚科分类系统,即（（（Ambleminae+Gonideinae）+Rectidentinae）+Unioninae）+Parreysiinae;珍珠蚌科2亚科分类系统,即（Gibbosulinae+Margaritiferinae）;中国蚌类隶属蚌科4亚科（Gonideinae,Rectidentinae,Unioninae,Parreysiinae）13族和珍珠蚌科两亚科（Gibbosulinae,Margaritiferinae）.基于化石标定的分子钟显示：蚌科物种分化时间为中三叠世（median=232.07 Ma）,其中雕刻蚌亚科（Parreysiinae）起源和物种分化时间早于其他亚科;矩形蚌亚科（Rectidentinae）物种分化时间最晚,为晚白垩世（median=94.72 Ma）;小方蚌亚科（Ambleminae）和隆脊蚌亚科（Gonideinae）最近共同祖先分化于晚侏罗纪世（median=144.69 Ma）,珍珠蚌科起源于晚石炭世（median=312.61 Ma）,物种分化于晚白垩世（median=91.59 Ma）,中国蚌科现生物种最早起源时间可追溯到白垩纪（中国尖嵴蚌（Acuticosta chinensis）,median=114.36 Ma）.蚌超科线粒体基因重排分析显示：蚌超科线粒体基因组有4种基因排列方式（GO）,珍珠蚌科独享一种（GO1）;蚌科中Unioninae和Ambleminae共享一种（GO2）;Gonideinae有2种基因排列方式（GO3和GO4）,其中室蚌（Chamberlainia hainesiana）独享一种（GO4）,其余物种共享一种（GO3）.以往作为高阶元分类的贝壳形态、钩介幼虫形态以及育儿囊类型,并不能作为蚌科属及以上阶元分类依据.本研究重构了世界蚌目聚焦于蚌超科的系统发育关系和进化历史,建立了中国蚌类分类系统,为今后该类群区系多样性研究及资源保护提供了分类依据.  相似文献   

极地微生物基因组挖掘现状与展望          下载免费PDF全文

廖丽  陈波 《极地研究》2020,32(2):133-139

测序技术的快速发展极大地促进了微生物基因组相关研究。极地微生物基因组的测序与研究虽然启动略晚,但迅速成为极地微生物研究的一个重要内容。极地微生物基因资源具有重要的战略意义与社会效益,但针对极地微生物基因组的深入研究以及基因资源的深度挖掘仍然非常有限,没有真正发挥基因组测序的作用与价值。本文总结了国际上极地微生物基因组相关研究现状与主要的研究方向,分析了极地微生物基因组挖掘潜力与目前研究的不足之处,并在此基础上提出了重点需要突破的方向。极地微生物基因资源潜力巨大,加强对极地微生物基因资源的挖掘将为未来生物技术的发展提供更多可能性。  相似文献