我国海域两种大型水母的分子鉴定   总被引：6，自引：2，他引：4       下载免费PDF全文

张姝  张芳  刘媛  崔朝霞 《海洋与湖沼》2009,40(1):94-101

采用通用引物-PCR扩增法,测定了辽宁营口海蜇成体的部分16S基因序列578bp、部分COI基因序列633bp,以及黄海海域沙海蜇成体部分COI基因序列645bp、部分16S基因序列479bp.结果表明,海蜇个体间的16S序列只有一个变异位点,其余序列完全一致;COI序列共有4个变异位点,碱基之间只存在转换,没有颠换、插入或缺失的位点.沙海蜇个体间的COI序列碱基组成完全一致,16S序列碱基组成也完全一致.从辽宁盘锦和山东胶州所取的水母碟状体和稚水母的测序结果显示,COI序列与海蜇成体的差异为0.5%-0.6%,与沙海蜇成体的差异为18.9%-19.4%;16S序列与海蜇成体的差异为0.0%-0.2%,与沙海蜇成体的差异为13.1%-13.3%.以上结果表明,水母碟状体和稚水母都为海蜇而非沙海蜇.结合GenBank中已有的其它水母类COI基因同源序列信息,构建分子系统发育树.结果显示:轮环水母亚目(Kolpophorae)和指环水母亚目(Daktyliophorae)以及有肩板族(Scapulatae)和无肩板族(Inscapulatae)的分类划分,与传统分类一致.从分子水平上证明,在黄海海域采集的沙海蜇和在日本采集的越前水母的差异只处于种内水平,两者应为同物异名.  相似文献   

中国近海5个黑鲷地理群体的遗传变异   总被引：1，自引：0，他引：1  

赵爽  章群  乐小亮  彭博  许忠能  韦桂峰  李贵生 《海洋科学》2010,34(2):75-79

为有效保护和利用黑鲷(Acanthopagrus schlegeli)资源,本研究测定了中国近海5个群体(北方海域的营口与崂山群体,南方海域的闽清、大亚湾、东兴群体)各10尾黑鲷线粒体控制区5′端722bp序列以分析其遗传多样性和遗传结构。结果发现42个单倍型,56个多态位点;群体单倍型多样性为0.978～1.000,群体核苷酸多样性为0.0067～0.0116。中性检测和核苷酸不对称分布分析表明,中国近海黑鲷在晚更新世(165～41kaBP)曾经历过种群的快速扩张。北方群体与南方群体之间的Fst值为0.1145(P=0.00),表明存在中等程度的分化,建议将中国近海黑鲷作为两个管理单位。  相似文献   

东南沿海小孔蛸(Cistopus sp.)线粒体序列的比较研究          下载免费PDF全文

杨秋玲  林祥志  郑小东  苏永全 《海洋与湖沼》2009,40(5):640-646

采用线粒体DNA 16S rRNA和COⅠ基因序列对福建、浙江沿海分布的5个小孔蛸(Cistopus sp.)群体进行了遗传多样性研究。结果表明,序列总长度分别为497-501bp(16S rRNA)和652bp(COⅠ);小孔蛸5个群体的序列碱基组成均显示出较高的A+T含量(16S rRNA基因72.1%,COⅠ基因65.9%)。16S rRNA基因片段在种内和群体间个体差异均较小,5个群体共检测到8个变异位点(其中7个插入/缺失位点);COⅠ基因序列不存在插入/缺失位点,群体内个体间变异位点数为21个。系统进化树表明,宁德群体和象山群体与其它三个群体的亲缘关系较远,但存在基因交流。线粒体16S rRNA和COⅠ基因在群体间无显著多态性分布。  相似文献   

小黄鱼(Larimichthys polyactis)线粒体基因组结构与特征   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

柳淑芳  吴仁协  朱玲  庄志猛 《海洋与湖沼》2010,41(6):885-894

采用长片段扩增策略,获得鲈形目石首鱼科黄鱼属小黄鱼的线粒体基因组全序列。组装分析结果表明,其长度为16470bp,H链碱基组成呈明显反G偏倚,G含量仅为16%。13个蛋白质基因起始密码子均为ATG。COI基因的终止密码子为AGA,ND1和ND3基因为TAG,COII、ND4和Cytb基因为不完全终止密码子T,其余7个基因都是完整的TAA。在小黄鱼mtDNA中发现2个特殊发夹结构,一个是轻链复制起始区(OL)的发夹环,位于tRNA簇,环区T含量仅为9%,而G含量达45%,这与哺乳动物和爪蟾该区域富含T有所不同。另一个假定发夹结构位于ATP6基因末端,这种二级结构可能与准确转录有关。该mtDNA控制区长度为799bp,5′端含有9个连续TA串联重复和2个5′-ATGTA---TACAT-3′重复,与已报道的鱼类扩展终止相关序列模式恰恰相反;中央控制区仅识别出CSB-E结构;保守序列区含有CSB-1,2,3,其中CSB-2具有高度保守性。对小黄鱼和大黄鱼的mtDNA比较进化研究,根据分子钟假说,估计二者线粒体基因组的进化分歧时间为4.8百万年前。  相似文献   

彩虹明樱蛤基因组DNA提取及RAPD扩增的初步研究   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

於宏  薛良义  张佳峰 《海洋科学》2009,33(3):4-9

对采自浙江温岭的彩虹明樱(Moerella iridescens)养殖群体的DNA提取和RAPD扩增条件进行了研究.从38种随机引物中筛选到重复性好的6种引物分别对11个个体的DNA进行扩增,共产生247个DNA条带(300～1 600 bp),总共检测到43个位点,其中多态位点32个,多态位点比例为74.42%.11个个体间的遗传相似系数在0.553～0.884之间,平均为0.691,个体间的平均遗传距离为0.309.表明该群体的遗传多样性比较丰富,种质资源处于良好状态.  相似文献   

基于Parkin信号通路研究加味丹参饮对缺氧复氧心肌细胞线粒体自噬的影响          下载免费PDF全文

杨艳红  李立  吴若霞 《应用海洋学学报》2022,38(6):174

目的：通过体外建立大鼠心肌细胞缺氧复氧（HR）损伤模型，观察加味丹参饮（JWDS）能否通过激活Parkin蛋白介导的线粒体自噬而发挥对缺血再灌注心肌的保护作用。方法：将H9C2心肌细胞传代培养后，随机分为5组，分别为正常对照组（NG）、模型组（HRG）、模型组+空白血清处理组（BSG）、模型组+加味丹参饮含药血清组（JWDSG）、模型组+加味丹参饮含药血清+Mdivi-1组（JDMG），应用免疫印迹法比较各组心肌细胞内Parkin蛋白、Beclin-1蛋白的表达情况。结果：与NG组比较，HRG、BSG、JDMG、JWDSG的Parkin、Beclin-1蛋白表达均有所升高，差异均有统计学意义（P<0.05）；与BSG、JDMG组比较，JWDSG的Parkin、Beclin-1蛋白表达升高，差异均有统计学意义（P<0.05）；HRG、BSG、JDMG 3组之间，以上2项指标比较，差异均无统计学意义（P>0.05）。结论：加味丹参饮可能通过调控Parkin蛋白通路，激活线粒体自噬相关蛋白，发挥减轻心肌缺血再灌注损伤的作用。  相似文献   

深海微生物极端酶的研究进展          下载免费PDF全文

李升康  王玉桥 《海洋科学》2009,33(5):98-102

21世纪是海洋的世纪,海洋生物资源的开发和利用已成为世界各海洋大国竞争的焦点之一,其中基因资源的争夺更是焦点中的重点.  相似文献