合浦珠母贝基因组DNA多态性的RAPD标记   总被引：2，自引：0，他引：2  

杜晓东  叶富良 《广东海洋大学学报》2000,20(2):83-84

  相似文献   

粤西镇海湾近江牡蛎线粒体16S rRNA基因序列变异分析   总被引：2，自引：1，他引：1  

苏天凤  江世贵  朱彩艳  吴进锋 《广东海洋大学学报》2004,24(4):1-5

采用聚合酶链式反应 (PCR)技术对粤西镇海湾水域的近江牡蛎Crassostrearivularis(Gould)群体 2 7个个体的线粒体DNA16SrRNA基因序列片段进行扩增 ,获得大约 5 0 0bp的扩增产物。PCR产物经纯化后进行序列测定 ,经ClustalX同源排序 ,除去引物及部分端部序列 ,得到4 14bp的核苷酸片段。 2 7个个体共检测到 2个变异位点 ,均为颠换位点 ,没发现碱基位点插入、缺失及转换位点 ,共 3种单倍型 ,每个单倍型只有一个碱基的差异。运用DNASP软件计算得该群体的核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别为 0 .0 0 0 36和 0 .14 815。此结果提示镇海湾近江牡蛎群体遗传多样性已很低 ,很有必要从其他分布区引进近江牡蛎亲贝来扩大该种群的遗传多样性  相似文献   

单环刺螠中肠和后肠交替氧化酶对硫化物的应激反应     

任志强  张立涛  刘晓龙  刘建国  张志峰 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2015,45(2):66-71

外源性硫化物可通过抑制或阻断线粒体电子传递经典途径而对生物体产生损伤甚至致死,交替氧化酶(Alternative Oxidase,AOX)是线粒体硫化物氧化电子传递分支途径中的1个关键酶。为了研究硫化物环境中单环刺螠的生存对策,本文利用间接竞争性ELISA和酶活性分析等技术检测了单环刺螠在硫化物应激前后中肠和后肠中AOX的蛋白含量以及活性的变化。结果显示:在未处理的单环刺螠中,后肠的AOX蛋白含量和酶活性均高于中肠。当单环刺螠暴露在硫化物(50和150μmol·L-1)环境中时,2个器官的AOX含量和酶活性水平均随着硫化物浓度的提高和暴露时间的延长而提高,并且150μmol·L-1硫化物处理组的单环刺螠2个器官AOX蛋白含量和酶活性普遍高于相同处理时间下的50μmol·L-1组。结合已报道的单环刺螠硫化物应激下细胞色素c氧化酶活性的变化,提出单环刺螠体内存在线粒体电子传递分支途径;提高组织线粒体中AOX活性是其应对环境硫化物毒性的对策之一。  相似文献   

北极深海沉积物中细菌和古菌群落结构研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

LI Yan  LIU Qun  LI Chaolun  DONG Yi  ZHANG Wenyan  ZHANG Wuchang  XIAO Tian 《海洋学报(英文版)》2015,34(2):93-113

在北极深海沉积物生态系统中,微生物的群落结构由有机质输入、能量的可用性及其他环境因素决定.然而,全球气候变暖及其导致的冰盖提前融化正在影响微生物的多样性.为描述北极深海沉积物中的微生物群落结构及其与环境因素的相关性,我们利用罗氏454对北极深海沉积物样品的16S rDNA扩增子进行了测序,对细菌和古菌群落的丰富度、成分、结构及其系统发育分类地位进行了描述.硫还原和化能有机营养类是细菌群落中的主要类群;而古细菌群落主要是由微生物的关系最为密切的氨氧化奇古菌门(96.66%)和产甲烷古生菌界(3.21%).这项研究描述了北极极点附近深海沉积物(> 3500米)中的微生物多样性,将为以后研究类似环境中微生物代谢过程和途径等功能分析奠定基础.  相似文献   

3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段的序列比较     

陈子安  杜晓东  王庆恒  邓岳文 《广东海洋大学学报》2007,(4)

对裸体方格星虫(Sipunculus nudus)、可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)和澳洲管体星虫(Siphonosoma australe)的线粒体16S rRNA、COI和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行比较,并对其系统发生进行了初步探讨。采用PCR方法得到总长度分别为531～544bp(16S)、652～675bp(COI)和406～453bp(Cytb)的线粒体片段。片段碱基A+T比例较高(16S rRNA基因58.3%,COI基因56.9%,Cytb基因59.5%)。16S rRNA片段存在169个碱基变异位点(其中包括167个简约信息位点)和44个碱基插入/缺失,种内个体间变异较小;COI片段有512个碱基(333个简约信息位点)存在变异,79个碱基插入/缺失;Cytb片段存在347个碱基(318个简约信息位点)变异位点,16个碱基插入/缺失。数据分析结果支持3种星虫和环节动物的分类地位较近,与软体动物较远的分类观点。此外,裸体方格星虫与澳洲管体星虫之间亲缘关系较近(D=0.3159、0.3156、0.2361)。认为3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cytb基因在种间存在明显的多态性,证实了三种基因序列均普遍适用于星虫种及以上阶元的系统学分析。  相似文献   

3种星虫线粒体16S rRNA、COⅠ和Cyt b基因片段的序列比较     

陈子安  杜晓东  王庆恒  邓岳文 《广东海洋大学学报》2007,27(4):3-10

对裸体方格星虫（Sipunculus nudus）、可口革囊星虫（Phascolosoma esculenta）和澳洲管体星虫（Siphonosoma australe）的线粒体16S rRNA、COⅠ和细胞色素b（Cyt b）基因片段序列进行比较,并对其系统发生进行了初步探讨.采用PCR方法得到总长度分别为531～544 bp（16S）、652～675 bp（COⅠ）和406～453 bp（Cyt b）的线粒体片段.片段碱基A＋T比例较高（16S rRNA基因58.3%,COⅠ基因56.9%,Cyt b基因59.5%）. 16S rRNA片段存在169个碱基变异位点（其中包括167个简约信息位点）和44个碱基插入/缺失,种内个体间变异较小;COⅠ片段有512个碱基（333个简约信息位点）存在变异,79个碱基插入/缺失;Cyt b片段存在347个碱基（318个简约信息位点）变异位点,16个碱基插入/缺失.数据分析结果支持3种星虫和环节动物的分类地位较近,与软体动物较远的分类观点.此外,裸体方格星虫与澳洲管体星虫之间亲缘关系较近（D=0.3159、03156、0.2361）.认为3种星虫线粒体16S rRNA、COⅠ和Cyt b基因在种间存在明显的多态性,证实了三种基因序列均普遍适用于星虫种及以上阶元的系统学分析.  相似文献   

星洲银罗非鱼线粒体细胞色素b基因的序列分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

刘楚吾  李路  林晓坤  刘丽 《广东海洋大学学报》2008,28(4)

克隆并测定了星洲银罗非鱼(Oreochromis sp.)细胞色素b基因(cyt b)的全序列,得到全长1 141bp的序列用于分析,用MEGA4.0分析软件与GenBank中的线粒体DNA序列进行序列比较,显示星洲银罗非鱼与其他鱼类的cyt b基因的同源性较高,同源度介于83%~93%间;根据星洲银罗非鱼与莫桑比克罗非鱼、尼罗罗非鱼等12种鱼类的cyt b基因序列构建的系统进化树,初步确定尼罗罗非鱼、莫桑比克罗非鱼为星洲银罗非鱼的父母本。  相似文献   

Study on the Free Radical Scavenging Activity of Sea Cucumber （Paracaudina chinens vat.） Gelatin Hydrolysate     

ZENG Mingyong XIAO Feng ZHAO Yuanhui LIU Zunying LI Bafang DONG Shiyuan 《中国海洋大学学报(英文版)》2007,6(3):255-258

Gelatin from the sea cucumber （Paracaudina chinens var.） was hydrolyzed by bromelain and the hydrolysate was found to have a high free radical scavenging activity. The hydrolysate was fractionated through an ultrafiltration membrane with 5 kDa molecular weight cutoff （MWCO）. The portion （less than 5 kDa） was further separated by Sephadex G-25. The active peak was collected and assayed for free radical scavenging activity. The scavenging rates for superoxide anion radicals （O2·^-） and hydroxyl radicals （·OH） of the fraction with the highest activity were 29.02% and 75.41%, respectively. A rabbit liver mitochondrial free radical damage model was adopted to study the free radical scavenging activity of the fraction. The results showed that the sea cucumber gelatin hydrolysate can prevent the damage of rabbit liver and mitochondria.  相似文献   

基于全基因组重测序对ARTP诱变的一株高产淀粉酶韩国普李斯特氏菌的关键基因研究          下载免费PDF全文

何伟  王灵  刘景川  黄仕新  李菁菁  黄家琪  龙腾  吴鹏  范坚强  邓小华  陈善义  陈义强  唐旭 《应用海洋学学报》2024,43(1):171-182

为提高一株海洋来源的韩国普李斯特氏菌（Priestia koreensis FS 1）产淀粉酶的能力，对该株菌采用常压室温等离子体（atmospheric and room temperature plasma, ARTP）技术进行了诱变选育。结果显示：经过诱变选育后得到一株产淀粉酶活力较原始菌株提高了90%且稳定遗传的突变菌株P. koreensis FS 103。为解析该突变菌株酶活力增加的分子机制，对突变菌株P. koreensis FS 103进行了全基因组重测序及比对分析研究。相关分析显示：首先，P.koreensis FS 103的基因组中乙酰化修饰、抗氧化作用以及同义突变相关的基因发生了遗传变异；其次，对COG（clusters of orthologous groups）功能和变异基因进行富集分析，P. koreensis FS 103转录、翻译和翻译后修饰过程相关基因均上调。经过ARTP诱变以后的突变菌株P. koreensis FS 103淀粉酶活力提升的原因是以上功能基因发生上调效应。  相似文献   

Molecular phylogeny of familiar flatfish species(Pleuronectidae) in the northwestern Pacific Ocean based on mitochondrial cytochrome oxidase I gene   总被引：2，自引：0，他引：2  

ZHANG Yan  XIAO Yongshuang  Gao Tianxiang 《海洋学报(英文版)》2008,27(2):93-101

A molecular phylogenetic analysis was undertaken to evaluate the present systematic status of commercially familiar Pleuronectidae fishes in the northwestern Pacific Ocean. We sequenced a 529 bp fragment of the mitochondrial DNA （mtDNA） COl gene from 34 individuals of these familiar flatfishes from 11 species of nine genera collected in China and Japan. Genetic relationships among haplotypes of specimens from 11 species for COI gene data were reconstructed using the neighbour-joining method and the maximum parsimony （MP） method. The resulting molecular phylogeny of the 11 species, with a few exceptions, supported the existing taxonomy which was based largely on the morphological characteristics. The most noteworthy findings were that the genus Pleuronichthys diverged before deriving of the common ancestor for the other species; the stone flounder, Kareius biocoloratus, should belong to the genus Platichthys with the latin name Platichthys biocoloratus and the genus Verasper was not the extraordinary differ- entiation from the other species in family Pleuronectidae. The resultant phylogenetic trees were also consistent with multiple origins of direct development within family Pleuronectidae. New proof not only for further illuminating the multiple origins of Pleuronectidae but also for confirmation of the evolutionary relationships among groups in the family will be supported.  相似文献