许氏平鲉(Sebastes schlegelii)速生选育群体的生长性能与遗传特征分析     

刘阳  韩慧宗  王腾腾  孙娜  张明亮  王斐  冯艳微  杜荣斌  姜海滨 《海洋与湖沼》2018,49(2):432-443

本研究目的为开展许氏平鲉(Sebastes schlegelii)遗传改良和优质新品系选育,选取荣成(R)和长岛(C)的野生许氏平鲉为基础群体,采用群体选育(群体内和群体间)和家系选育相结合的方法,获得R-F1、RC-F1两个群体选育群体和R-F2、RC-F2、R-F3、RC-F3四个家系选育群体。对4个选育家系的生长性能进行比较分析,并利用20对高多态性的微卫星标记对8个群体进行遗传多样性检测。结果表明:(1)群体内和群体间家系选育子3代比家系选育子2代生长速度分别提高21.59%和30.99%。4个选育家系后代的绝对增重率随着天数的增加而上升,群体内家系选育(R-F3)的生长速度、绝对增重率显著大于群体间的杂交选育系(RC-F3),杂交系未表现出生长的杂种优势。(2)20对微卫星位点在所有群体中均表现出较高多态性,8个群体的平均有效等位基因数(Νe)为2.9849—7.9598,平均观测杂合度(oH)和期望杂合度(He)分别为0.7230—0.8405和0.6315—0.8716,平均多态信息含量(PIC)为0.6472—0.8478。经两代家系选育的R-F3和RC-F3平均等位基因数显著降低,但观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)均值仍达到0.7230、0.7549和0.6527、0.6315,还有维持了较高的遗传多样性水平,遗传潜力较大。Hardy-Weinberg平衡检测结果和遗传偏离指数(d)表明各群体在大约10个位点上表现出一定程度的杂合子缺失现象。群体间平均遗传分化系数(Fst)为0.1279,各群体间存在中等遗传分化程度。R与R-F1分别与RC-F3遗传距离最远(0.9959、0.9848),预测利用两组群体中生长优良个体分别进行杂交育种有可能获得杂种优势。  相似文献   

大规模三维城市建模进展     

单杰  李志鑫  张文元 《测绘学报》2019,48(12):1523-1541

大规模三维城市模型在城市规划与管理、环境模拟、应急响应、导航、虚拟旅游以及其他科学和大众应用方面的需求越来越高。在过去的20年中,通过多学科的共同努力,大规模城市三维建模已经取得了可观的成就。本文全面总结和讨论了三维城市建模在数据源、建模方法和平台、模型表达和互操作等方面的新技术和新进展,并描述了世界范围内开放城市模型的几个代表性示例。在日益多样化的数据,先进但价格可承受的技术以及不断增长的公共和科学需求的推动下,三维城市建模正在加速实现自动化、细致化、语义化、标准化、一体化和大众化。  相似文献   

基于种特异性PCR及线粒体基因标记的天津沿海牡蛎物种多样性研究     

黄津伟  张天喆  高燕  吴弘  高雨  闫春财  胡利莎 《海洋科学》2019,43(12):89-96

天津位于渤海湾西北部,海岸线长,牡蛎生物量大,但是关于天津海区牡蛎种类组成未见有详细报道。为了解此地区牡蛎物种多样性情况,本研究对天津沿海自南至北5个地点随机采集了约230个野生牡蛎,结合形态学和分子生物学手段,利用种特异性(Species-specific)PCR分子标记及COI基因序列详细地分析了牡蛎物种组成。种特异性PCR可以快速鉴定并确认牡蛎种类,结果表明天津沿海牡蛎优势种为北方常见种长牡蛎Crassostrea gigas gigas,另外一种不能通过种特异性PCR确定,但经形态鉴定及COI基因片段的Genbank Blast比对,确定其为猫爪牡蛎Crassostrea talonata。综合形态学和分子生物学手段,研究结果表明大神堂有长牡蛎和猫爪牡蛎两种牡蛎,其余4个地点的牡蛎均为长牡蛎。总体来看,天津沿海牡蛎物种多样性较低,这与北方沿海潮间带牡蛎生长的生态环境如水温、盐度等有关。本研究采集的牡蛎个体普遍偏瘦小,可能与沿海频繁的人为采捕有关,此结果为我国天津沿海牡蛎的种类、分布及其他相关研究提供了参考,为野生牡蛎的合理保护提供了依据。  相似文献   

翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)EST-SSR标记与生长性状相关性及4个选育群体遗传结构研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

袁文成  叶金明  黄鹤忠  肖攀  路瑶  李泽  朱传坤 《海洋与湖沼》2018,49(1):224-231

采用翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)转录组高通量测序并筛选得到的13对多态性EST-SSR引物,对60尾翘嘴鳜的体长、体高、体厚及体重4种生长性状进行标记-性状相关性研究,并对4个翘嘴鳜选育群体各30尾个体进行遗传结构分析。结果显示,与其生长性状显著相关的微卫星分子标记有5个,包括:分别与体厚和体长极显著相关(P0.01)和显著相关(P0.05)的标记C10127,AA型为体长、体厚的优势基因型,而AC型为劣势基因型;与体重显著相关(P0.05)的标记C19016,AA型为体重的优势基因型,AB型为体长的劣势基因型;与体厚显著相关(P0.05)的标记C14847,BB型为体厚的优势基因型;分别与体长、体高和体重、体厚极显著相关(P0.01)和显著相关(P0.05)的标记C12350,BC型为体长、体厚、体高和体重性状的优势基因型;分别与体厚、体重和体高极显著相关(P0.01)和显著相关(P0.05)的C18691标记,BB型为体厚、体重和体高性状的优势基因型。4个翘嘴鳜群体遗传多样性高低依次为太湖选育群体长江口选育群体洪泽湖选育群体鄱阳湖选育群体,其平均的等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为2.2115、1.9405、0.55513、0.5925和0.3775,属于中度多态水平。  相似文献   

地图编制与应用     

《中国地理与资源文摘》2009,(3)

  相似文献   

用于赤潮藻分子系统学研究的遗传及分子标记   总被引：2，自引：0，他引：2  

陈国福  张春云  王广策  张宝玉 《海洋科学进展》2008,26(4)

各种遗传标记及分子标记技术被广泛地用于赤潮藻的分子系统学研究,为形态鉴定方法提供了辅助依据,对揭示赤潮生物的多样性有重大的推动作用。通过综述并分析用于赤潮藻分子系统学研究的遗传和分子标记,认为交叉运用各种遗传标记及多种分子标记技术进行分析,是今后快速准确鉴定赤潮藻研究的趋势。  相似文献   

南海海域4种笛鲷的微卫星DNA分析     

郭煜嵩  刘楚吾 《广东海洋大学学报》2007,27(6):7-12

摘要：采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术，从20对西大西洋笛鲷（Lutjanus campechamus）的微卫星引物中筛选适用于红鳍笛鲷（L．erythopterus）、勒氏笛鲷（L.russellii）、紫红笛鲷（L.argentimaculatus）和约氏笛鲷（L.johnii）基因组分析的微卫星引物，分析4种笛鲷的遗传多样性及系统发生。经反应条件的优化，从20对引物中筛选出17对可稳定扩增出特异片段的引物。通过测序证实扩增产物含微卫星位点后，以该17对引物对4个种的群体进行遗传多样性分析。其中16对可在约氏笛鲷、勒氏笛鲷、紫红笛鲷基因组中扩增出重复性好的特异性条带，分别有65％、65％、60％呈现出种内多态：15对可在红鳍笛鲷中扩增出重复性好的特异性条带，并且全部呈现出种内多态。四种笛鲷中，红鳍笛鲷的多态性最高，高度多态基因座占检测座位的66．67％；勒氏笛鲷的多态性最低，低度多态基因座占43．75％。获得3个种间特异性分子标记。用风和DA两种方法计算4种笛鲷的遗传距离，构建了系统发生树。  相似文献   

利用微卫星DNA标记对南海湛江海域军曹鱼群体遗传多样性的分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

刘丽  刘楚吾  梁宁 《热带海洋学报》2008,27(6)

从10对美国密西西比州海泉市近海军曹鱼Rachycentron canadum的微卫星引物中选出5对多态性好的引物对中国南海湛江海域军曹鱼48个个体进行遗传多样性研究.结果表明,5个微卫星位点的等位基因数目、有效等位基因数、多态信息含量和杂合度分别在2-9、1.552 9-7.339 7、0.324 2-0.856 3和0.356 0-0.863 8之间,说明中国南海湛江海域军曹鱼的遗传多样性处于较高的水平.通过比较,证明其遗传多样性比密西西比州海泉市近海军曹鱼的遗传多样性丰富.建议在军曹鱼资源没有受到破坏时,采取相应的策略对其进行保护.  相似文献   

基于微卫星标记的真鲷放流群体与增殖海域群体遗传变异比较分析     

赵雨  孙典荣  单斌斌  刘岩  杨长平  周文礼 《海洋科学》2020,44(10):66-73

真鲷（Pagrus major）是中国沿岸海域重要的经济种类，增殖放流作为修复真鲷渔业资源、恢复自然群体的方法，现已在中国被广泛地应用。然而，将大量人工繁育的苗种投入自然海域中，可能会对自然群体造成一定程度的遗传学影响。因此，在开展真鲷增殖放流的同时，应进行遗传监测。本研究使用7对真鲷微卫星标记，对2017年于防城港沿岸海域开展的真鲷增殖放流进行遗传监测，对比分析了真鲷亲体、放流真鲷苗种以及放流后混合群体的遗传多样性。研究结果表明，真鲷亲本群体与真鲷放流群体的等位基因丰度（13.525 3，16.428 6）和期望杂合度（0.792 7，0.814 5）没有明显的差异，表明在苗种繁育过程中，没有出现遗传多样性丢失的现象。真鲷放流群体和放流后混合群体的期望杂合度（0.814 5，0.822 8）、等位基因丰度（16.428 6，16.755 5）相似，表明真鲷放流群体和放流后混合群体处于相同的遗传多样性水平。3个群体的多态信息含量为0.768 8~0.805 5，表明3个群体均具有较高的遗传多样性。群体间遗传分化指数（0.016 667）和遗传距离（0.265 375~0.301 915）的结果显示群体间的遗传分化微弱，未形成明显的遗传分化。因此，可认为本研究中真鲷增殖放流未对放流后混合群体造成明显的遗传学影响。本研究为今后真鲷增殖放流遗传监测提供了理论参考依据。  相似文献   

有害藻华的宏条形码分析:机会与挑战   总被引：3，自引：3，他引：0  

陈楠生 《海洋科学》2020,44(7):116-134

宏条形码分析（metabarcoding analysis）是通过对野外样本的分子标记（即条形码）进行PCR扩增、测序，并利用测序结果分析野外样本物种组成、物种相对丰度，及其时空动态变化。这项在近20年里逐步发展起来的分子技术，得益于DNA测序技术的快速发展，包括测序通量的提升和测序成本的降低，以及生物信息学分析方法的快速开发。基于可操作分类单元（operational taxonomic units，OTUs）分析方法，特别是最近的扩增子序列变异（amplicon sequence variants，ASVs）方法的开发，极大促进了宏条形码分析的应用。在世界及我国的海洋生态领域，宏条形码分析的应用还处于起步阶段。随着分析方法的日趋成熟，可适用于不同应用领域的分子标记不断增加，以及参考数据库的不断完善，宏条形码分析将释放出广阔的应用潜力。可以预期，宏条形码分析将在系统分析我国近岸海域有害藻华物种（及其他浮游生物物种）的组成和相对丰度中起关键作用，通过发现新物种，辨别隐存种，跟踪物种的生物地理学，进而帮助解析有害藻华暴发机理。  相似文献