基于线粒体控制区序列的黄海日本鳀(Engraulis japonicus)的群体遗传结构*     

邹聪聪  王丽娟  吴志昊  尤锋 《热带海洋学报》2021,40(5):25-35

遗传多样性和群体遗传结构是研究群体动态变化的重要内容, 也是种质资源评估与保护的基础。日本鳀(Engraulis japonicus)是我国东部近海的重要鱼种, 具有重要的生态价值和经济价值。文章利用线粒体控制区全序列分析了黄海海域4个地理群体(北黄海北部、北黄海南部、南黄海北部和南黄海中部)日本鳀的遗传多样性、种群遗传结构和历史动态变化。结果显示, 131个样品检测到了126个单倍型, 且4个群体的单倍型多样性均很高, 其中北黄海南部群体的最低(0.995±0.009), 南黄海中部群体的最高(1.000±0.014)。而核苷酸多样性均较低, 为0.010±0.005 ~ 0.011±0.006。主成分判别分析(DAPC)和遗传分化系数F_st表明4个群体无明显的群体分化现象, 群体间的遗传同质性水平高, 分子方差分析(AMOVA)也显示分子变异基本来自于群体内, 并且没有明显的群体遗传结构。贝叶斯系统发育树分析发现, 黄海日本鳀有2个谱系, 谱系1和谱系2的分化时间为0.701Ma前, 可以追溯到更新世期间; 进一步中性检验和核苷酸错配分布分析表明这2个谱系可能发生过群体扩张。贝叶斯天际线图则显示黄海鳀鱼的有效群体数量在0.150Ma前发生了明显的下降。  相似文献   

牙鲆(Paralichthys olivaceus)与大菱鲆(Scophthalmus maximus)受精前期微管骨架的免疫荧光观察          下载免费PDF全文

朱香萍  尤锋  张培军  徐永立 《海洋与湖沼》2008,39(2):190-196

利用免疫荧光显微技术研究观察了牙鲆和大菱鲆正常二倍体受精卵从胚盘形成到4-细胞期微管骨架的动态变化过程,获得了一系列中心体、纺锤体及核的变化图像。牙鲆和大菱鲆正常发育的受精卵中微管骨架结构-纺锤体和中心体的动态变化过程基本相似,纺锤体及微管的形态结构也基本相似,大部分受精卵的微管骨架结构随卵裂呈现明显的周期性变化。在相同培育温度下,大菱鲆受精卵的胚盘形成时间要比牙鲆受精卵的胚盘形成时间晚10min左右,这与解剖镜下现场观察的结果相一致。首次利用免疫荧光显微技术从分子细胞生物学角度对牙鲆和大菱鲆进行细胞学观察,为进一步对其进行染色体操作提供分子细胞学依据。  相似文献   

半滑舌鳎和塞内加尔鳎养殖群体遗传变异的RAPD分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

杨奔  尤锋  李军  吴志昊  王波  徐冬冬  于道德  倪静  徐世宏  徐永立  张培军 《海洋科学进展》2008,26(4)

采用RAPD方法对半滑舌鳎和塞内加尔鳎的养殖群体进行遗传变异分析。从78条随机引物中筛选出20条用于群体遗传学分析,2个群体共扩增出260条DNA片段,其中半滑舌鳎187条,塞内加尔鳎180条,片段大小为200-2 000 bp。半滑舌鳎和塞内加尔鳎养殖群体的多态片段比例分别为63.10%和60.56%,Nei的多样性指数和Shannon的信息指数分别为0.266 4和0.237 5,0.385 2和0.349 8。与其它鲆鲽鱼类养殖群体相比,半滑舌鳎和塞内加尔鳎养殖群体的遗传多样性水平略低;2种鱼群体间的遗传相似性系数和遗传距离分别为0.458 3和0.723 1,它们的遗传变异主要来自群体内。  相似文献   

Genetic variation of natural and cultured stocks of Paralichthys olivaceus by allozyme and RAPD     

尤锋  张培军  王可玲  相建海 《中国海洋湖沼学报》2007,25(1):78-84

Population genetics of the left-eyed flounder, Paralichthys olivaceus, including natural and cultured stocks distributed in the coastal waters near Qingdao of eastern maritime China, was analyzed in allozyme and RAPD. The results showed that among total 29 gene loci of 15 isozymes, 9 and 7 were po- lymorphic in natural and cultured stocks, respectively. The status of genetic diversity in P. olivaceus is low in terms of polymorphic loci in chi-square test and genetic departure index of Hardy-Weinberg equi- librium. More alleles in IDHP, CAT, GDH and Ldh-C allozymes were found in the fish, which could be used as markers in assortive breeding and distinguishing stock, population or species evolution. Total 88 and 86 RAPD bands ranging from 200 to 2 500 bp were recognized individually in average of 7.8–8.0 bands per primer. The genetic diversity in cultured stock is lower than that in natural ones showing an ob- viously decreasing genetic divergence. Therefore, effective countermeasures must be taken to protect ge- netic resources of marine cultured fishes. The 2 markers have their own pros and cons. Combining the 2 markers to investigate the genetic variation of populations is suggested. The results provide basic data of this flounder and they are useful for studying genetic improvement and genetic resources of the fish.  相似文献   

Preliminary study on mitochondrial 16S rRNA gene sequences and phylogeny of flatfishes （Pleuronectiformes）     

尤锋 刘静张培军  相建海 《中国海洋湖沼学报》2005,23(3):335-339

A 605 bp section of mitochondrial 16S rRNA gene from Paralichthys olivaceus, Pseudorhombus cinnamomeus, Psetta maxima and Kareius bicoloratus, which represent 3 families of Order Pleuronectiformes was amplified by PCR and sequenced to show the molecular systematics of Pleuronectiformes for comparison with related gene sequences of other 6 flatfish downloaded from GenBank. Phylogenetic analysis based on genetic distance from related gene sequences of 10 flatfish showed that this method was ideal to explore the relationship between species, genera and families. Phylogenetic trees set-up is based on neighbor-joining, maximum parsimony and maximum likelihood methods that accords to the general rule of Pleuronectiformes evolution. But they also resulted in some confusion. Unlike data from morphological characters, P olivaceus clustered with K.bicoloratus, but P cinnamomeus did not cluster with t3. olivaceus, which is worth further studying.  相似文献   

大菱鲆四倍体的人工诱导研究     

吴志昊  尤锋  宋宗诚  胡金伟  王丽娟  朱香萍  谭训刚  李军 《海洋与湖沼》2014,45(3):657-662

大菱鲆(Scophthalmus maximus)为我国北方沿海主要的海水经济品种,其四倍体的获得对种质改良和三倍体的规模化生产具有重要的价值。到目前为止,有关大菱鲆四倍体的人工诱导尚未见报道。本文采用静水压抑制受精卵卵裂的方法,进行了四倍体诱导条件的摸索。结果显示,在14.8—15.5?C培育时,在卵裂前15min用67.5MPa处理6min可获得较好的诱导效果,其孵化率最高可达72%,染色体制片计数法计算其原肠胚期诱导率可达70%,初孵仔鱼流仪检测诱导率最高为73%。诱导组胚胎发育与对照组在形态学上基本一致,仅发育孵化时间比对照组略有滞后。  相似文献   

大菱鲆三倍体人工诱导条件优化及规模化诱导     

宋宗诚  吴志昊  王丽娟  胡金伟  岳新璐  尤锋 《海洋科学》2019,43(12):42-49

大菱鲆(Scophthalmus maximus)是我国重要的海水养殖鱼种,三倍体诱导对其种质改良、产业提升和生态安全具有重要的价值。目前有关大菱鲆三倍体的人工诱导虽已有报道,但对其诱导条件缺乏细致的研究。本文采用冷休克法抑制第二极体排放,通过对诱导处理起始时刻、温度和持续时间3个主要因素的单因子实验,筛选其最佳诱导条件。结果显示,在受精和孵化水温为15.0±0.5℃条件下,受精后6 min,用–2～–1℃处理25 min可获得较好的诱导效果,流式细胞仪检测其诱导率可达100%。随后在最适条件下进行了规模化诱导,获得鱼苗200万尾以上,其诱导率高于98%。跟踪观察发现,三倍体诱导组胚胎的形态及孵化时间与二倍体对照组基本一致。本研究结果可为大菱鲆三倍体的产业化应用提供基础。  相似文献   

荣成湾孔鳐群体线粒体DNA cytb部分序列的遗传多样性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

刘梦侠  王丽娟  孔令怡  刘洪军  吴志昊  辛梦娇  张伟  尤锋 《海洋科学》2012,36(10):85-92

对2009 年和2011 年采自荣成湾的孔鳐(Raja porosa)群体共54 尾鱼的线粒体DNA 细胞色素b基因(cytb)部分序列进行测定, 以分析其遗传多样性和群体遗传结构。结果显示, 在所获得的782 bp 序列中, 共检测到11 个单倍型、15 个多态位点, 其单倍型多样性指数(H)为0.498±0.081, 核苷酸多样性指数(π)为0.0018±0.0005, 遗传多样性水平较低。其中, 2009 年样品检测到3 种单倍型、4 个单一变异位点, 其H 和π 值分别为0.378±0.181 和0.0010±0.0006; 2011 年样品检测到9 种单倍型、6 个单一变异位点和6 个简约信息位点, 其H 和π 值分别为0.352±0.086 和0.0020±0.0006。分子方差分析(AMOVA)分析显示它们的遗传变异主要集中在同年度个体间(98.22%), 而不同年度个体间的遗传变异远远小于同年度内个体间的变异。Kimura’s 2-parameter 模型分析得到的2009, 2011 年度孔鳐间的遗传距离为0.0013, 遗传分化系数为0.01778, 也表明2009 年和2011 年孔鳐的遗传分化程度低, 没有明显的遗传变异。中性检验表明, 荣成湾孔鳐群体可能发生过种群扩张。  相似文献   

牙鲆Lhx1基因的克隆和表达分析     

翁申达  尤锋  范兆飞  文爱韵  王丽娟 《海洋科学》2013,37(11):1-8

Lhx1基因对于哺乳动物卵巢缪勒氏管的形成具有重要作用, 但鱼类中的报道仅限于其在体轴和肾脏形成中的作用, 尚未见到其与性别及性腺发育相关的报道。本研究克隆获得了牙鲆(Paralichthys olivaceus)Lhx1a和Lhx1b开放阅读框(ORF)序列, 长度分别为1224 bp 和1206 bp (GenBank 注册号为:JX999940、JX999941), 同源序列比较显示牙鲆Lhx1a和Lhx1b基因均具有两个LIM 及一个HOX 结构域, 符合Lhx1进化保守性。这两个基因在牙鲆雌、雄成鱼各组织RT-PCR 差异表达谱不尽相同, Lhx1a在精巢中弱表达, 卵巢中不表达, 在其他组织中雌、雄表达谱差异不大, 都只在脑和眼组织有弱表达;而Lhx1b的表达在性腺中相对较高, 且卵巢的表达量高于精巢。进一步检测牙鲆Lhx1a和Lhx1b在雌、雄性腺发育各期的表达谱, 发现这两个基因表达集中于Ⅲ、Ⅳ期性腺, Lhx1a在精巢中弱表达, Lhx1b卵巢中的表达明显高于精巢, 而在Ⅰ、ⅡII、Ⅴ期性腺几乎均不表达。由此推断牙鲆Lhx1a 和Lhx1b均为性别相关基因, 但在两性性腺发育中的作用可能各有不同。  相似文献   

牙鲆17β-HSD1基因克隆及其表达调控的初步研究     

梁冬冬  范兆飞  邹玉霞  谭训刚  吴志昊  焦爽  李军  尤锋 《海洋科学》2017,41(9):65-73

17β-羟类固醇脱氢酶1(17β-HSD1)的主要作用是将雌酮(El)转化为发挥功能的雌二醇(E2)。作者从牙鲆(Paralichthys olivaceus)性腺转录组数据库获得该基因的开放阅读框(ORF)序列,对其进行了验证,并分析了该基因在高温、外源性激素处理条件下性腺分化期性腺组织中的差异表达以及c AMP和转录因子(NR5a2和NR0b1)在精巢原代细胞中对该基因表达的作用。结果显示,牙鲆17β-HSD1基因的ORF为873bp,编码290个氨基酸,与其他鱼类的有很高的相似性。半定量RT-PCR结果表明,该基因在卵巢中高表达,精巢有少量表达,并且在雌性个体的鳃、头肾、肾、脾、胃和肠中也有表达。实时定量RT-PCR结果显示,该基因在卵巢或精巢分化的关键时期表达量较高;在精巢原代培养细胞中,外源信号分子c AMP及转录因子NR5a2可以显著下调17β-HSD1基因的表达(P0.05),且呈现剂量效应,转录因子NR0b1对该基因的调控也与剂量有关。作者推测牙鲆17β-HSD1基因在性腺分化中起一定的作用,其表达受到调控因子的作用,这些结果将有助于增加对鱼类性腺分化和发育的认识。  相似文献