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1.
多样性指数在海洋浮游植物研究中的应用 总被引：109，自引：12，他引：97
对海洋浮游植物群落分析中常用的多样性指数进行了比较研究.对物种丰富度依赖型、丰度依赖型和实测浮游植物群落中物种丰富度、Shannon指数(以2或e为底)、Pielou均匀度指数、Simpson指数(1-D或1/D形式)、Margalef指数、Berger-Parker指数、McIntosh指数、McIntosh均匀度指数、Brillouin指数、Brillouin均匀度指数、Fisher α指数和Q统计指数等不同多样性指数计算结果进行了比较,发现不同多样性指数对浮游植物群落多样性的分析存在明显差异.对于一般情况下浮游植物群落多样性的研究,物种丰富度、Margalef指数、Fisher α指数、Shannon指数、Simpson相遇指数和Pielou指数的综合使用是较合适的,但对Margalef指数和Fisherα指数的结果要谨慎解释.并在综合应用各指数的基础上提出了浮游植物群落多样性分析的一般步骤. 相似文献
2.
Assemblage structure is related to slope and depth on a deep offshore Pacific seamount chain 
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下载免费PDF全文 Scientific study has generated a range of hypotheses about the ecological structure and function of seamounts. Interpretations of these ideas and data are vital to understanding how seamount communities will respond to anthropogenic impacts. Here, we examine how diversity and structure of seamount assemblages vary with depth and slope of the sea floor. We conducted ROV video transects on three seamounts of the Taney Seamount Chain in the Northeast Pacific Ocean. Depth and slope were both related to assemblage structure on the Taney seamounts. Depth differences were seen in alpha‐ and beta‐diversity but not density. Beta‐diversity and density but not alpha‐diversity varied with slope. Overall, slope and depth together explained 14–31% of beta‐diversity. The findings suggest that differences in beta‐diversity as related to depth gradients may differ among onshore and offshore and/or between shallow and deep summit seamounts. Specifically, we hypothesize that differences in productivity and depth gradients among seamounts may generate different patterns of beta‐diversity. 相似文献
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莱州湾主要无脊椎动物资源及其群聚多样性特征 总被引：3，自引：0，他引：3
于１９８４年４－１１月在莱洲湾不域进行资源调查。分析表明，主要２２种虾、蟹和头足类的捕获量为３７２４００尾，８８４３ｋｇ；动物种类多样性Ｈ＇值为１．８０－２．３６。其中春季（５月）Ｈ＇值较高，为２．３６夏季（８月）的为１８９；秋季（１１月）的仅为１．８０。显示种类多样性为中等偏低，种类群聚结构较简单。这３个季度月的种类多样性等值线分布趋势是，莱州湾中部和黄河口北侧的Ｈ＇resume 相似文献
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海南红树林根系土壤中可培养细菌的多样性分析 总被引：3，自引：0，他引：3
为研究海南红树林根系土壤细菌多样性,充分发掘中国红树林特有微生物资源,作者于2012年12月份从10份采集于海南北港岛红树林根系淤泥样品中分离可培养海洋细菌,并基于16S rRNA基因序列分析的方法对样品中的细菌多样性进行研究。共分离得到122株海洋细菌,经并菌后选取其中的70株代表性菌株测序,结果发现它们分为4个类群:变形菌门(主要为γ-变形菌纲)(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria),分别占66%,19%,11%和4%。共代表30个属47个种,其中有9个潜在新种和2个潜在新属。本研究结果表明,北港岛红树林中存在着丰富的细菌多样性,很多类群可能是红树林特有细菌物种。 相似文献
6.
The diversity of modular polyketide synthase (PKS) genes in sediments of Ardley Island in Antarctica, was studied by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. Phylogenetic analysis of 14 amino acid (AA) sequences indicates that the identified ketosynthase (KS) domains were clustered with those from diverse bacterial groups, including Cyanobacteria, γ-Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes, and some unidentified microorganisms from marine sponge, bryozoan and other environmental samples. The obtained KS domains showed 43%-81% similarity at the AA level to reference sequences in GenBank. Six identified KS domains showed diverse sequences of the motif (VQTACSTS) that was used to identify the hybrid PKS/nonribosomal peptide synthetase (NRPS) enzyme complex, and formed a new branch. These results reveal a high diversity and novelty of PKS genes in antarctic sediments. 相似文献
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The diversity of modular polyketide synthase (PKS) genes in sediments of Ardley Island in Antarctica, was studied by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. Phylogenetic analysis of 14 amino acid (AA) sequences indicates that the identified ketosynthase (KS) domains were clustered with those from diverse bacterial groups, including Cyanobacteria, γ-Proteobacteria, Actinobacteria, Firmicutes, and some unidentified microorganisms from marine sponge, bryozoan and other environmental samples. ... 相似文献
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取红鳍笛鲷(Lutjanus erythopterusBloch)、紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatusFor-skal)、勒氏笛鲷(Lutjanus russelliBleeker)和约氏笛鲷(Lutjanus johniBloch)肝脏组织,分离纯化其线粒体DNA,用限制性内切酶酶切进行了限制性片段长度多态性分析。在红鳍笛鲷共发现4种单倍型,单倍型间的平均遗传距离为0.010 1,其mtDNA多态度为0.002 9。在紫红笛鲷共发现6种单倍型,单倍型间的平均遗传距离为0.015 1,其mtDNA多态度为0.005 5。在勒氏笛鲷共发现3种单倍型,单倍型间的平均遗传距离为0.008 6,其mtDNA多态度为0.001 2。在约氏笛鲷共发现5种单倍型,单倍型间的平均遗传距离为0.008 3,其mtDNA多态度为0.002 0。 相似文献
9.
高通量测序技术广泛应用于环境真核微生物多样性的研究,可检获较之传统形态学方法更高的多样性。然而,检获的高分子多样性与基于形态的物种多样性在构成上的差异仍然不明。本研究首次对比分析了基于形态学的南黄海沉积物中的纤毛虫物种多样性与基于核糖体18S DNA和c DNA高通量测序的多样性异同。结果表明:形态鉴定获得8纲、20目、30科、36属共97种纤毛虫;DNA测序检获10纲、28目、55科、76属共174个OTUs;而通过c DNA测序获取的纤毛虫多样性最高,获10纲、31目、68科、99属共284个OTUs。研究发现,形态学方法检获的纤毛虫均为底栖生纤毛虫;两种分子手段检获的多样性更高,群落结构更为近似,覆盖了形态鉴定所获的绝大部分类群。但DNA测序还检获了序列比例高达90%的浮游类群,可能源于包囊或死亡沉降的物种;而c DNA测序检获了约7%的浮游纤毛虫序列。较之DNA测序,c DNA法检获的底栖纤毛虫在群落结构上与形态学结果更为接近。本研究表明,分子手段有助于更全面地揭示沉积物中的纤毛虫多样性,DNA测序可同时揭示休眠包囊、胞外DNA及过去群落的信息,而c DNA测序在研究活动纤毛虫多样性上更有优势。 相似文献
10.
Isolation and phylogenetic assignation of actinomycetes in the marine sediments from the Arctic Ocean 总被引：2，自引：0，他引：2
Actinomycetes in five marine sediments collected from the Arctic Ocean at depths of 43 to 3 050 m were cultivated using a variety of media. A total of 61 actinomycete colonies with substrate mycelia only were observed, and no colonies with aerial mycelia were observed under aerobic conditions at 15 ℃. From these colonies, 28 were selected to represent different morphological types.Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) was used to check the purity of isolates and select representatives for subsequent sequencing. Phylogentic analyses based on nearly full-length 16S ribosomal RNA gene (rDNA) sequences indicated that the actinomycetes isolated were accommodated within genus Rhodococcus of family Nocardiaceae, genus Dietzia of family Dietziaceae,genera Janibacter and Terrabacter of family Instrasporangiaceae and genera Kocuria and Arthrobacter of family Micrococcaceae. One of the strains (P27-24) from the deep-sea sediment at depth of 3 050 m was found to be identical in 16S rDNA sequence(1474/1474)with the radiation-resistant Kocuria rosea ATCC 187T isolated from air. More than halfofthe isolates showed the similarities ranging from 99.5% to 99.9% in 16S rDNA sequence to dibenzofran-degrading, butyl 2-ethylhexanoate-hydrolysising and nitrile-metabolizing actinomycetes. All the strains isolated were psychrotolerant bacteria and grew better on the media prepared with natural seawater than on the media prepared with deionized water. Three of them (Dietzia sp. P27-10, Rhodococcus sp. S11-3 and Rhodococcus sp.P11-5)had an obligate growth requirement for salt, confirming that these strains are indigenous marine actinomycetes. 相似文献
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南海北部海盆晚第四纪钙质超微化石及其古海洋学初步研究 总被引：1，自引：0，他引：1
黄永样 《海洋地质与第四纪地质》1993,13(3):75-84
本文根据南海北部海盆HY4—2柱状样的钙质超微化石分析结果,阐述了本区晚第四纪钙质超微化石分布特征,化石的溶解作用及暖水种化石的分布规律。依此对区内晚第四纪的地层及古气候环境进行了初步讨论。结果表明,柱状样所揭露的地层包括上更新统和全新统。其古气候包括了三个暖期和二个冷期等五个气候期。 相似文献
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浙江5个海湾鱼类分类多样性研究 总被引：1，自引：0，他引：1
本文基于2014年11月(秋季)和2015年5月(春季)在三门湾开展的渔业资源调查,结合杭州湾、象山湾、台州湾与乐清湾等4个相似的海湾的相关资料作为对照,依据《中国海洋生物名录》分别构建5个海湾的鱼种名录。以分类多样性指数、分类阶元包含指数、G-F多样性指数等进行多维度析。结果表明:平均分类差异指数(Δ+)象山湾最高(56.01),三门湾最低(48.79)。分类变异差异指数(Λ+)亦为象山湾最高(553.83),三门湾最低(313.63),由此可见象山湾鱼类在各分类阶元分布最不均匀,三门湾最均匀。关于分类阶元包含指数,三门湾鱼类的科、属、种的分类阶元包含指数值均较高;在目级水平上,杭州湾鱼类分类阶元包含指数最低,其余分类阶元上象山湾鱼类最低。G-F指数分析结果显示则显示:象山湾G-F指数最高(0.62),杭州湾最低(0.43)。由此得出,在目级水平上台州湾与乐清湾之间相似性最高(0.84),相似性最低的是三门湾与象山湾(0.5);在科级水平上台州湾与乐清湾之间相似性最高(0.71),相似性最低的是象山湾与台州湾(0.54)。综上,象山湾鱼类分类多样性最高,三门湾最低。本文通过揭示5个海湾鱼类多样性特征及差异,以期为鱼类资源的开发、利用、保护和管理等应用研究提供科学依据。 相似文献
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海湾扇贝养殖群体遗传多样性的研究 总被引：13，自引：4，他引：13
用等位基因酶的聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,研究了大连沿岸不同生态环境条件下的大李家湾低排筏、大李家湾高排筏、凌水桥、棋盘磨4个海湾扇贝养殖群体的遗传多样性.在4个群体的7种等位基因酶和闭壳肌蛋白中均检测到了22个基因位点,各群体的多态位点比例分别为22.73%,22.73%,22.73%,18.18%(P≤0.95)和27.27%,27.27%,31.82%,36.36%(P≤0.99);杂合度观测值分别为0.064,0.071,0.075,0.069;Hardy-Weinberg平衡偏离指数分别为-0.068,-0.020,-0.032,-0.050;近交系数分别为0.568,0.565,0.487,0.550;位点等位基因有效数分别为1.102,1.109,1.143,1.122;遗传变异综合评价指数分别为0.0060,0.0071,0.0088,0.0073.海湾扇贝养殖群体遗传多样性总体水平较低,但在这4个群体中,凌水桥群体的遗传多样性水平最高,大李家湾高排筏和棋盘磨群体的遗传多样性水平较高,大李家湾低排筏群体遗传多样性水平最低. 相似文献
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根据自行分离的翘嘴鳜微卫星序列（GenBank登录号：DQ789247-DQ789306）设计并合成20对微卫星引物,对鳜属鱼类4个物种即翘嘴鳜、大眼鳜、斑鳜和暗鳜共80个个体进行了物种鉴定分析.结果表明,20对微卫星引物共检测到293个等位基因,大小在80-301bp之间.它们在4个物种中的多态性位点百分率分别为90%、75%、85%和85%,累积个体识别率和非父排除率均达到0.9999,属于高识别力的微卫星遗传标记系统,可以用来进行鳜属鱼类物种的鉴定分析.UPGMA聚类分析表明,翘嘴鳜与暗鳜之间亲缘关系最近,可归属于第Ⅰ类;大眼鳜为第Ⅱ类;斑鳜独自为第Ⅲ类.本研究可为鳜属鱼类的分类及进化关系、群体遗传结构分析等提供理论支持,为野生原种鳜类遗传多样性的监测和评估以及鳜类优良的种质资源得到合理保护和开发利用奠定基础. 相似文献
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斜带石斑鱼不同地理群体遗传变异的微卫星分析 总被引：1，自引：0，他引：1
筛选5时可分析引物对斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)台湾群体和广东群体的DNA多态性进行分析.根据电泳检测结果,平均每个引物获得4.2个等位基因,未发现群体的特异位点.获得2个群体平均观测杂合度(H_o)分别为0.672 1和0.682 6,平均期望杂合度(H_e)分别为0.647 9和0.544 4,两群体间的遗传分化系数(F_(ST))为0.011 0.统计结果表明,2个群体有着较高的遗传变异性,群体间的遗传分化程度处于多数海水鱼类的平均水平. 相似文献
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Genetic diversity and specific markers in four scallop species, Patinopecten yessoensis,Argopecten irradians, Chlamys nobilis and C.farreri 总被引：1，自引：0，他引：1
The AFLP （amplified fragrnent length polymorphism）technique was used to analyse the genetic diversity in four scallop species, Patinopecten yessoensis, A rgopecten irradians, Chlamys nobilis and C. farreri. The genetic similarity indexes of these four species are 0.8415, 0.7863, 0.7190 and 0.6731, while Shannon diversity indexes are 43.52, 58.87, 80.16 and 92.83, respectively. As analyzed, the genetic diversities in two native species, i.e., C, farreri and C. nobilis, are higher than those in other two introduced species, A. irradians and P. yessoensis. The results also showed that C. nobilis and C, farreri shared the most common loci. The genetic distance indicated that C. nobilis and C. farreri are closely related. Moreover, out of 510 AFLP markers, 21 specific bands are found to distinguish the four species scallops and these markers may be applied to the specific germplasm characterization and molecular assistant classification in scallops. 相似文献
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黄鳍鲷2个自然群体遗传变异的RAPD分析 总被引：6，自引：0，他引：6
用RAPD技术对福建和珠江口2个自然黄鳍鲷(Sparus latus)群体进行群体内与群体间的遗传变异分析。在使用的40个随机引物中．有18个引物扩增出清晰稳定的片段，共计93条，大小为200-2500bp，其中多各性片段41条．多态性片段的比例为44．09％。福建和珠江口群体内的相似系数分别为0．8821和0．8785．群体内遗传距离分别为0．1179和0．1215，2个群体间的遗传距离为0．1314。福建和珠江口2个群体内都有较高程度的遗传变异水平，但福建群体的遗传变异水平较珠江口群体的低。用类平均聚类法和邻接法进行聚类分析，结果表明．福建和珠江口群体分别聚成一支，且两者的聚类结果一致。说明福建和珠江口群体已经开始出现了遗传分化，分别属于2个不同的地理群体。 相似文献
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黄海和东海三疣梭子蟹(Portunus triuberbuculatus)的AFLP分析 总被引：1，自引：0，他引：1
应用AFLP分子标记技术对我国三疣梭子蟹黄海和东海两群体共40个个体利用10对选择性引物组合进行了遗传多样性分析。共扩增出411个位点,多态位点333个。黄海和东海群体的多态位点比例,Nei基因多样性指数和Shannon遗传多样性信息指数分别为74.5%、63.1%,0.2553、0.2355,0.3827、0.3497,两群体的遗传多样性均处于同一水平。群体间遗传分化系数Gst、Shannon遗传多样性信息指数表明,两群体的遗传变异主要来源于群体内个体间。UPGMA聚类图及两群体的Gst和遗传距离显示两群体间出现了一定的遗传分化。 相似文献
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条斑紫菜5个栽培品系的ISSR分析 总被引：2，自引：2，他引：0
利用ISSR-PCR方法对条斑紫菜(Porphyrayezoensis)5个栽培品系进行遗传多态性分析,优化了PCR反应体系和反应参数。从100个ISSR引物中筛选23个引物扩增了217个DNA片段,其中201个片段呈现多态性,占总扩增片段的92.6%。依据扩增结果进行遗传相似性和遗传距离分析,构建分子树状图。结果表明,在条斑紫菜5个品系中,采自南通海区的2个品系首先聚在一起,其遗传距离为0.3897;接着依次和来自青岛的2个野生品系聚类,两个野生品系间的距离为0.4299;原种来自日本的样品与其他4个样品相距最远,平均遗传距离为0.4469。同时,5个紫菜品系的ISSR分析中产生了一些特有的指纹图谱,可进一步应用于种质分析的研究。 相似文献