鰶亚科两种鱼类的线粒体16S rRNA基因片段序列的比较研究     

宋林  韩志强  高天翔 《海洋湖沼通报》2007,(1):125-129

对鰶亚科两种鱼类的线粒体16S rRNA基因片段进行了PCR扩增和序列测定,分析比较了两种间的序列差异。斑鰶(Konosirus punctatus)16S rRNA基因片段长度为572bp,在3个个体中检测到2个单倍型,花鰶(Clupanodon thrissa)序列长度为575bp,两种间存在30个核苷酸位点(5.2%)的变异。基于木村双参数进化模型得到两种间的遗传距离为0.043。以太平洋鲱和寿南小沙丁为外群构建的NJ树表明,斑鰶和花鰶的亲缘关系较近,而与美洲真鰶(Dorosoma cepedianum)的亲缘关系较远。  相似文献   

用精子载体法将MT-hGH基因导入泰山赤鳞鱼   总被引：7，自引：1，他引：7  

翟玉梅  鹿培源  崔博文  王喆  时永香  杨晓梅  赵晶  岳永生 《海洋与湖沼》2001,32(1):37-41

于1998年3月－1999年2月，在山东农业大学采集泰山赤鳞鱼，采用精子载体法进行MT－hGH基因导入的研究。将泰山赤鳞鱼的精子在保存液内与含有MT－hGH基因的重组质粒保温30min，然后用于人工授精，共孵化出363尾幼鱼。待鱼苗长至5cm左右时，对其中的39尾进行PCR和Southern杂交检测。结果表明，有7尾鱼苗带有MT－hGH基因,转基因鱼的阳性率为17．95％。  相似文献   

白骨壤铜锌超氧化物歧化酶基因片段的克隆与序列分析     

杨盛昌  谢潮添  刘敏 《海洋科学》2004,28(1):43-47

以红树植物白骨壤(Avicennia marina)基因组DNA为模板，根据超氧化物歧化酶基因保守序列设计特异引物进行PCR扩增，得到特异基因片段。回收该基因片段，与pMD18-T载体连接,并转化到感受态大肠杆菌ER2566细胞，获得铜锌超氧化物歧化酶基因片段的克隆。序列分析表明白骨壤铜锌超氧化物歧化酶基因片段含4个外显子和3个内含子，编码78个氨基酸,与水稻、玉米、红薯和白杨相应氨基酸序列的同源性分别为83．3％，84．6％，84．6％和87．2％。  相似文献   

聚合酶链反应(PCR)检测花鲈鳗弧菌感染     

余俊红  陈吉祥  厉云  苟万里  纪伟尚  徐怀恕 《海洋科学进展》2002,20(2):60-64

从海洋鱼类重要病原菌———鳗弧菌基因库中选择金属蛋白酶基因为目标检测基因 ,以此设计一对引物 ,建立聚合酶链反应 (PCR)检测鳗弧菌的方法 ,并对此方法的灵敏性和特异性进行了研究 ,结果表明该方法对鳗弧菌的检测快速、灵敏。对人工感染鳗弧菌的花鲈组织样品进行检测 ,该方法能识别组织样品中极微量的鳗弧菌。  相似文献   

短沟对虾和斑节对虾酚氧化酶原基因的克隆和序列分析   总被引：7，自引：1，他引：7       下载免费PDF全文

叶星  郑清梅  白俊杰  劳海华  简清  罗建仁 《海洋与湖沼》2003,34(5):533-540

采用RT-PER原理和长片段扩增技术克隆短沟对虾和斑节对虾酚氧化酶原基因。设计合成特异引物、提取血细胞总RNA，反转录后扩增获得的特异片段回收并克隆到pGEM-TEasyVector系统的T载体上，重组子进行碱基序列测定。结果表明，所克隆的短沟对虾酚氧化酶原基因含起始密码子A1B到终止密码子TGA的2055bp，编码684个氨基酸。斑节对虾酚氧化酶原基因含ATG到TGA的2061bp，编码686个氨基酸。短沟对虾酚氧化酶原推算分子量为78153Da，等电点pI为6．25；斑节对虾则为78581Da，pI为5．83，用DNA分析软件分析显示两种对虾酚氧化酶原基因具有高度的同源性，二者的碱基和推测的氨基酸序列同源性分别为93％和92％；对虾与其他节肢动物酚氧化酶原基因的同源性的高低与种类间亲缘关系相关；不同种类间酚氧化酶活性中心重要组成部分的2个铜结合位点、位于铜结合位点内的6个组氨酸以及与铜结合位点相邻的氨基酸序列高度保守。  相似文献   

三疣梭子蟹线粒体DNA 16S rRNA和COI基因片段序列的比较研究   总被引：19，自引：2，他引：19  

郭天慧  孔晓瑜  陈四清  喻子牛 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2004,34(1):22-28

本文采用 PCR扩增和序列测定等技术 ,对三疣梭子蟹 (Portunustrituberculatus)线粒体DNA1 6Sr RNA和 COI基因片段进行了初步研究。经 PCR扩增和序列测定 ,分别得到 1 6Sr RNA和 COI2个基因片段的碱基序列 ,其中 1 6Sr RNA基因片段的大小为 566bp,碱基 A,T,G,C的含量分别为 35.1 6% ,34.45% ,1 2 .37%和 1 8.0 2 % ;COI基因片段的大小为 658bp,碱基 A,T,G,C的含量分别为 36.63% ,2 6.44% ,2 0 .52 %和 1 6.41 %。在 2种基因片段中 ,AT含量均明显高于 GC含量 ,这与果蝇、虾类、蟹类等无脊椎动物的 1 6Sr RNA和 COI基因片段研究结果相似。通过对三疣梭子蟹 1 6S r RNA和 COI2个基因片段遗传特征的研究 ,发现其种内变异较低 ,在 3个样本中 1 6Sr RNA基因片段序列完全一样 ,COI基因片段中也只有 2个 T/ C位点转换。另外 ,比较本研究所得序列与 Gen Bank中梭子蟹科 5个属的 1 6Sr RNA基因片段序列后 ,发现其聚类结果与传统分类相一致。  相似文献   

条斑紫菜丝状孢子体cDNA文库构建及抗病相关基因鉴定   总被引：1，自引：3，他引：1  

杨官品  刘永健  孙雪  沈怀舜  许璞  张学成 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2003,33(1):47-52

经过微量总 RNA抽提、c DNA合成、c DNA扩增和克隆等步骤 ,构建了微量条斑紫菜丝状孢子体 c DNA文库 ,并进行了小规模表达序列标签分析。从 1 70条标签序列中鉴定出 6条抗病相关基因序列。这些序列可用于研制抗病单核苷酸多态性标记 ,辅助紫菜抗性遗传改良。  相似文献   

(S)-3-苄氧羰基氨基戊酸的合成     

张伟  宋妮  李英霞 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2006,36(Z1):83-84

以(S)-2-氨基丁酸为起始原料,经过氨基保护、重氮化、Wolff重排三步反应合成了海洋天然环酯肽Obyanamide中的β-氨基酸单元,总收率为65.2%。  相似文献   

泥蚶(Tegillarca granosa)血细胞转录组序列中免疫相关基因的结构与mRNA表达量分析     

钟爱华  储张杰  王伟洪  牟毅 《海洋与湖沼》2020,51(2):354-363

贝类血细胞直接参与异物吞噬和包囊作用,还在伤口修复、炎症反应过程中发挥重要作用,是机体免疫防御的承担者。本研究采用RNA-seq测序技术研究了鳗弧菌感染前后泥蚶血细胞的转录组序列,通过序列组装,获得了α-葡萄糖苷酶(GAA)、α-甘露糖苷酶(LAMAN)、芳基硫酸酯酶B(ASB)、天冬酰胺氨基葡萄糖酶(AGA)、整合素β3亚基(ITB3)、热休克蛋白9(HSPA9)和Toll相互作用蛋白(TOLLIP)序列,利用Orffinder获得了其编码蛋白序列,并对蛋白序列进行了理化性质、二级结构、保守结构域和三级结构分析。结果表明:7种蛋白质二级结构均含有α螺旋、β折叠及无规则卷曲,泥蚶和人类ITB3和TOLLIP具有相同的保守结构域, Swiss-model同源建模获得的三级结构与模板同源性均超过35%(TOLLIP除外)。鳗弧菌刺激后,GAA、LAMAN、ASB、AGA和HSPA9的表达量显著增加,ITB3和TOLLIP表达量变化不明显。该研究补充和完善了对泥蚶免疫相关基因的认识,并为进一步开展泥蚶抗病机理研究提供了重要的理论依据。  相似文献   

甲壳动物基因研究进展     

吴亚君  彭宣宪 《海洋科学》2001,25(8):19-23

基因克隆技术不断发展完善 ,不仅用来克隆已知功能基因 ,而且成功地克隆了一些未知基因 ,从而大大推动生物基因资源的开发。近年来 ,国外学者针对甲壳动物基因库 ,其中主要是经济类甲壳动物如虾、蟹及非经济类的卤虫（Ａｒｔｅｍｉａ）基因开展了细致的研究工作 ,分离鉴定到约３０多种功能基因 ,另外有线粒体基因 ,ｒＲＮＡ基因及一些重复序列。而国内在这方面的工作比较薄弱。研究该类动物基因 ,不仅拓展了已有的关于真核生物基因结构、功能、表达、进化等方面的知识 ,更重要的是 ,通过深入了解控制虾、蟹的重要经济性状如生长速度、发育调…  相似文献