斑鳢(Channa maculata)微囊藻毒素去毒相关基因sGST的克隆与序列分析          下载免费PDF全文

肖圣杰  梁旭方  廖婉琴  雷腊梅  韩博平 《海洋与湖沼》2007,38(3):234-239

采用RT-PCR技术和RACE技术成功克隆淡水鱼类斑鳢sGST基因cDNA全序列,推测得到氨基酸序列,初步分析其结构功能域及系统进化关系。结果表明,斑鳢sGST基因cDNA序列全长为898bp,编码225个氨基酸。斑鳢sGST与真鲷、金头鲷、鲽、黑头鲦、川鲽、大口黑鲈等最新定名为ρ型的sGST氨基酸同源性较高,ρ型sGST为水生生物所特有并共同占据进化树上独立的分枝;与大鼠、小鼠、人等哺乳动物sGST现有所有类型同源性均很低,并且在进化树上距离也较远,表明本研究成功克隆的sGST基因应属于ρ型,可能在鱼类等水生生物对水栖环境的适应上有重要作用。  相似文献   

海浪日最大波高序列的一种标度性质   总被引：1，自引：0，他引：1  

尉华  沈正 《海洋湖沼通报》1994,(4):1-8

应用重标度分析方法研究小麦岛海洋观测站１９６１－１９８０年二十年海浪日最大波高序列时发现，该序列并不是相互独立的，而是具有记忆性和持久性，详细的论证表明分式布朗运动模型是描述海浪日最大波高序列的一个较好的模型，同时，应用分式布朗运动模型我们找到了存在于海浪日最大波高序列中的一种标度性质－累积离差（ｔ）的统计自仿射性。  相似文献   

蛋白质组学的研究概况及其在海洋生物学中的应用   总被引：7，自引：0，他引：7       下载免费PDF全文

高政权  王广策  曾呈奎 《海洋与湖沼》2003,34(3):334-344

随着DNA序列测定技术的飞速发展，人们可以在很短的时间内获得某种生物基因组的全序列。生物体的生命活动主要依赖于基因组的产物——蛋白质组，但是蛋白质组的研究相对于基因组来说却要复杂得多。蛋白质组技术是在细胞内整体蛋白质水平上进行研究，从蛋白质整体活动的角度来研究生命活动的规律。综述了蛋白质组和蛋白质组学出现的背景、起源、概念、研究技术、研究内容、面对的挑战、开展该项研究的意义、陆生动植物和微生物蛋白质组学的研究进展及海洋生物蛋白质组学的研究概况。目前，普通生物方面的蛋白质组工作开展得较多，海洋生物方面却相对滞后。种种迹象表明，开展海洋生物蛋白质组学研究，对揭示生命的奥秘、促进海洋资源的开发都有重大的推动作用。  相似文献   

中国沿海亚历山大藻(Alexandrium)核糖体rDNA部分序列分析及该藻属分子系统进化研究   总被引：4，自引：1，他引：4  

唐祥海  于仁成  颜天  王云峰  周名江 《海洋与湖沼》2006,37(6):529-535

分析了几株自南海及东海分离的亚历山大藻的rDNA部分序列信息,其中包括核糖体大亚基(LSU)rDNA的5′端D1-D2区序列,以及5.8SrDNA和ITS区序列;同时也对实验室保种的部分来自其它国家和地区的亚历山大藻相关序列进行了测序和分析,并以此作为序列分析中的参考。采用ClustalX及MEGA2软件对所得到的序列信息进行了综合分析与对比。结果表明,分离自南海的塔玛亚历山大藻(Alexandriumtamarense)和分离自东海的链状亚历山大藻(A.catenella),即便是在ITS区和LSUrDNA等高变区,其序列信息也完全一致。与基因库中搜索到的其它亚历山大藻rDNA序列信息相比较,中国沿海的塔玛/链状亚历山大藻序列更接近于塔玛复合种的“亚洲温带”基因型。对于分离自南海的另外两株未定种的亚历山大藻,通过对比序列信息,发现它们与相关亚历山大藻(A.affine)非常接近。分离于我国台湾地区的微小亚历山大藻(A.minutum)在序列上与分离自新西兰的藻株相似,而与分离自欧洲的微小亚历山大藻藻株相差较大。中国沿海亚历山大藻rDNA序列信息的获得为针对有毒藻种设计特异性核酸探针,发展灵敏快速的生物检测技术奠定了基础。  相似文献   

东海原甲藻cDNA文库构建及尝试性EST分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

张秀芳  杨官品  刘永建  李瑞香  朱明远 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2006,36(3):361-364

东海原甲藻(Prorocentrumdonghaiense)是中国沿海频繁发生的大规模赤潮的原因种之一,大规模分离鉴定东海原甲藻功能基因是理解东海原甲藻赤潮形成过程和机理的重要基础。取对数生长期藻体,经微量总RNA抽提、cDNA合成、cDNA扩增和克隆等步骤,构建了东海原甲藻cDNA文库并进行了尝试性表达序列标签分析。从含有约5000个转化子的文库中随机取150个测序,获得126条EST序列。经网上BlastN及BlastX分析,共发现11个是已知功能的基因的标签。这些基因与东海原甲藻生长发育、物质转换和能量代谢相关。  相似文献   

Hydrocarbon Potential of Pre-cenozoic Strata in the North Yellow Sea Basin     

蔡峰戴春山  陈建文李刚 孙萍 《海洋通报(英文版)》2005,7(1):21-36

The North Yellow Sea Basin ( NYSB ), which was developed on the basement of North China (Huabei) continental block, is a typical continental Mesozoic Cenozoic sedimentary basin in the sea area. Its Mesozoic basin is a residual basin, below which there is probably a larger Paleozoic sedimentary basin. The North Yellow Sea Basin comprises four sags and three uplifts. Of them, the eastern sag is a Mesozoic Cenozoic sedimentary sag in NYSB and has the biggest sediment thickness; the current Korean drilling wells are concentrated in the eastern sag. This sag is comparatively rich in oil and gas resources and thus has a relatively good petroleum prospect in the sea. The central sag has also accommodated thick Mesozoic-Cenozoic sediments. The latest research results show that there are three series of hydrocarbon source rocks in the North Yellow Sea Basin, namely, black shales of the Paleogene, Jurassic and Cretaceous. The principal hydrocarbon source rocks in NYSB are the Mesozoic black shale. According to the drilling data of Korea, the black shales of the Paleogene, Jurassic and Cretaceous have all come up to the standards of good and mature source rocks. The NYSB owns an intact system of oil generation, reservoir and capping rocks that can help hydrocarbon to form in the basin and thus it has the great potential of oil and gas. The vertical distribution of the hydrocarbon resources is mainly considered to be in the Cretaceous and then in the Jurassic.  相似文献   

中国花鲈细胞色素b基因片段的序列研究(英文)     

高天翔  张秀梅  陈大刚  张美昭  任一平  张亚平 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(2)

参考鳗鲡等鱼类线粒体 DNA序列进行了中国花鲈线粒体 DNA细胞色素 b基因片断的引物设计、PCR扩增及其序列测定。得到中国花鲈的碱基序列为 4 10 bp,其 A、T、G、C含量分别为 10 1bp(2 4 .6 3% )、112 bp(2 7.32 % )、72 bp(17.56 % )、12 5bp(30 .4 9% ) ,与鳗鲡等其他鱼类相同基因片断序列碱基含量相似。  相似文献   

Application of the first internal transcribed spacer(ITS-1) of ribosomal DNA as a molecular marker to population analysis in farrer''s scallop Chlamys farreri     

YU Ziniu  WEI Xiaohu  KONG Xiaoyu  YU Shanshan 《海洋学报(英文版)》2007,26(1):93-100

Sequence variation of the first internal transcribed spacer of ribosomal DNA （ ITS - 1 ） was examined and its application to the study of genetic variation was explored in four populations of farter＇ s scallop Chlamys farreri. ITS - 1 fragments, with a length of about 300 bp,of 78 individuals collected from Dalian, Qingdao, Yantai in China and Korea respectively were amplified via PCR, cloned and sequenced. Intra-genomic variation was examined by sequencing several clones of single individuals. Alignment and polymorphism analysis detected 44 haplotypes and 50 polymorphic sites which consist of 30 substitutions and 20 indels, indicating a high level of polymorphisms. Sequence analysis also showed a very low level of intra-individual variation. All these features validated the feasibility of application of ITS - 1 fragment to population analysis. Polymorphism analysis showed that the Korea sample has the richest genetic variation, followed by Yantai and Qingdao samples. AMOVA （analysis of molecular variance） showed that the majority （96.26%） of genetic variation was distributed within populations and 3.74% resulted from among populations, but with P 〈 0.05 （ = 0.042）, indicating that the populations in this study have significant divergence. This output was basically concordant with the result arising from RAPD data and different from that from mitochondrial 16S rDNA sequence data. Discussion on this inconsistency was made accordingly.  相似文献   

西沙礁序列的磁性地层学研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

张明书  周墨清 《海洋地质与第四纪地质》1996,16(3):61-65

利用西沙群岛西琛一井３３０ｍ以上井段的１４９块岩心标本，用美国２－Ｇ型超导磁力仪进行了古地磁测定，获得了一个从更新世至中新世晚期包括布容，松山，高斯和吉尔伯特四个极性时及若干亚极性的磁性地层柱，为礁序列的划分对比，提供了新的依据。  相似文献   

时间序列分析的一种新方法     

潘增宪 《海洋信息》1993,(11):20-21

  相似文献