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41.
DNA甲基化在调节动物生长发育和组织分化中发挥了重要作用。本研究主要从酶切、预扩和选扩等方面优化了中国对虾DNA甲基化分析的MSAP技术,给出了适合中国对虾MSAP分析的最近反应程序和体系,并采用该技术分别对中国对虾选育群体"黄海1号"和野生群体的肌肉、鳃和血细胞三种组织基因组DNA的CCGG甲基化水平进行分析。研究结果表明,中国对虾野生群体肌肉、鳃和血细胞的DNA甲基化比例分别为23.1%、22.3%和19.7%,选育群体"黄海1号"肌肉、鳃和血液的甲基化比例分别为21.4%、19.6%和18.9%。鳃组织的DNA甲基化水平在两群体中差异极显著(P <0.01),肌肉间的甲基化水平差异显著(P <0.05),而血细胞中甲基化水平差异不显著(P >0.05)。中国对虾野生群体和"黄海1号"同一组织间的甲基化水平不同(P ≤ 0.05),而不同组织间的甲基化水平也各不相同(P ≤ 0.05)。DNA甲基化多态性分析表明,野生群体和选育群体"黄海1号"的鳃和血细胞组织的甲基化多态性比例变化明显,而肌肉组织甲基化水平较稳定,这些变化趋势与CCGG位点的甲基化和去甲基化有关。 相似文献
42.
采用室内暴露试验方法,以单细胞凝胶电泳技术(SCGE)检测,研究了Cu、Pb不同浓度梯度与不同暴露时间联合染毒对泥鳅卵细胞DNA的损伤.结果表明,各Cu、Pb浓度组DNA平均迁移长度增加,与阴性对照组比较差异有显著性(P＜0.05).此外,随着Cu、Pb染毒剂量的增加,各试验组DNA的平均迁移长度逐渐增加,在试验浓度梯度范围内(Cu 0.01mg/L+Pb 0.05mg/L、Cu 0.10mg/L+Pb 0.50mg/L、Cu 0.25mg/L+Pb 0.75mg/L),存在较为显著的剂量-效应关系(P＜0.05),但未见明显的时间-效应关系(P＞0.05).Cu、Pb可引起泥鳅卵细胞凋亡和DNA损伤,卵细胞的不同损伤水平可望作为较为理想的水环境基因毒性指标. 相似文献
43.
西沙群岛是我国南海陆地面积最大的群岛,海域广阔,拥有重要的战略地位与丰富的海洋资源。为了解该海域浮游动物组成与分布特征,本研究于2019年5月在西沙群岛14个岛礁站位开展多学科综合调查,并采用形态学方法和基于18S V9测序的宏条形码技术对浮游动物样本组成进行鉴定。结果显示,此次西沙调查站位浮游动物样本的主要种类包括桡足类、软甲纲和箭虫纲,这3个类别的物种在两种鉴定方法中均具有较高的相对丰度。14个站位浮游动物平均密度为707.53±378.34 ind/m3,各站位浮游动物丰度、物种组成及优势种存在差异。形态学方法共鉴定出11门17纲18目共86个物种,18S V9分子方法鉴定出22门46纲85目共233个操作分类单元(operational taxonomic units, OTUs),分子鉴定的物种覆盖度更高,且代表性类群相对丰度和多样性指数在大部分站位与形态学鉴定结果呈现出显著相关性,表明宏条形码技术鉴定方法与形态学鉴定方法在评价海洋浮游动物多样性方面具有较好的可比性,在我国海洋浮游动物群落监测中具有较高的应用潜力。但由于目前浮游动物的分子鉴定方法仍处于初步发展阶段,相关技术手段仍不完善,仍需多种鉴定方法结合使用,以保证浮游动物多样性鉴定的准确性。 相似文献
44.
众所周知鲳科鱼类均为重要的经济种类,在中国沿海仅见鲳属（Pampus）鱼类分布,而低鳍鲳属（Peprilus）和真鲳属（Stromateus）则分布于大西洋和东太平洋。本研究采用形态学和DNA条形码技术对海南、广西和广东水产品市场上出现的“南鲳”进行物种鉴定,同时下载该物种的COⅠ基因同源序列进行比较分析,并纠正GenBank中的错误序列。研究结果显示“南鲳”学名实为中间低鳍鲳（Peprilus medius）,为冰冻进口货品,在我国沿海无该物种的分布报道,其与国内已知的6种鲳属鱼类在鳃耙、背鳍、臀鳍等外部形态上存在明显的差异,在COⅠ基因水平上与鲳属鱼类遗传距离为 0.138,分化于中新世晚期。本研究可为水产品市场种类鉴定提供借鉴,也为鲳科鱼类的研究和海洋鱼类分类学提供基础数据和参考。 相似文献
45.
DNA条形码是指利用一段相对较短的标准DNA片段,对物种进行识别和鉴定。目前该技术在动物、植物物种鉴定领域已经得到了广泛的研究和应用。在藻类的研究中,尚未确定一条统一的标准条形码基因,现阶段都是使用2条或2条以上基因序列来完成物种鉴定。对于形态多样、种类繁多的海洋红藻,常用的DNA条形码基因有COI基因(Partial cytochrome c oxidase I gene)、UPA基因(Partial 23SrRNA gene,universal plastid amplicon)、LSU基因(Partial 28SrRNA gene)和rbcL基因(The large subunit of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase)等,这些基因中2个或3个基因的互补运用准确有效地提高了红藻的鉴定准确率,尤其是COI基因的种间差异大足够区分相近物种。本文在概述条形码的原理及其标准的基础上,阐述了红藻DNA条形码鉴定研究的新进展以及常用几种基因片段的优缺点,并对条形码在红藻鉴定中存在的问题进行了分析,对其应用前景进行了展望。 相似文献
46.
为鉴定鱼肚的正品来源,运用一对特异性引物扩增并测定10 个不同价格（700～1 500 元/kg）鱼肚样本的线粒体DNA 细胞色素c 氧化酶Ⅰ（cox1）约660 bp 的序列.通过BLASTN 比对DNA 序列同源度,判定鱼肚所属种类分别为鲈形目石首鱼科（Sciaenidae）、马鲅科（Eleutheronema）、笛鲷科（Lutjanidae）、带鱼科（Trichiuridae）.cox1 条码序列获取便捷,基于此条码序列的物种鉴定技术可用于鱼肚种类鉴别. 相似文献
47.
《青岛海洋大学学报(英文版)》2014,(1):97-103
An assessment with assistance of DNA barcoding was conducted on green macroalgae in coastal zone around Qingdao,China, during the period of April-December, 2011. Three markers were applied in molecular discrimination, including the plastidelongation factor tufA gene, the internal transcribed spacer （ITS） region of the ribosomal cistron and rubisco large subunit gene 3＇regions （rbcL-3P）. DNA barcoding discriminated 8 species, excluding species of genus Cladophora and Bryopsis due to failures inamplification. We ascertained and corrected 4 species identified by morphological methods for effectively assisting the classification.The gene tufA presented more advantages as an appropriate DNA marker with the strongest amplification success rate and speciesdiscrimination power than the other two genes. The poorest sequencing success largely handicapped the application of ITS. Samplesidentified by tufA and rbcL as Ulvaflexuosa were clustered into the clade of U. prolifera by ITS in the neighbor-joining tree. Confu-sion with discrimination of the complex of U. linza, U. procera and U. prolifera （as the LPP complex） still existed for the three DNAmarkers. Based on our results, rbcL is recommended as a preferred marker for assisting tufA to discriminate green macroalgae. Indistinguishing green-tide-forming Ulva species, the free-floating sample collected from the green tide in 2011 was proved to be iden-tical with U. prolifera in Yellow Sea for ITS and rbcL genes. This study presents a preliminary survey of green macroalgae distrib-uted in the coastal area around Qingdao, and proves that DNA barcoding is a powerful tool for taxonomy of green macroalgae. 相似文献
48.
大眼金枪鱼(Thunnus obesus)是世界最重要的渔业资源之一,经济价值较高,捕捞压力的加大使中部太平洋大眼金枪鱼过度捕捞程度愈发严重。开展种群遗传结构研究将为大眼金枪鱼资源的可持续利用与开发提供科学依据。本文以取自中西太平洋和中东太平洋共182尾大眼金枪鱼个体为研究对象,分析研究其线粒体DNA控制区第一个高变区(the first hypervariable region,HVR-1)457bp的序列,共发现115个变异位点,定义了178种单倍型。序列多样性分析结果显示:8个采样点核苷酸多样性在0.03074—0.04362之间,单倍型多样性在各个采样点都较高,变动范围在0.996—1.000之间;分子方差分析显示99.97%的遗传变异性来自于种群内;群体间的高基因交流值Nm和低分化指数Fst揭示中东太平洋与中西太平洋群体间基因交流频繁,不存在显著的遗传分化。 相似文献
49.
中国黄牛的起源及驯化一直是考古学家和遗传学家共同关注的热点问题。目前的研究多是基于古代黄牛遗骸的形态学鉴定和对现代地方黄牛品种的DNA分析,而针对中国古代黄牛的DNA研究尚少。本文对中国北方5个青铜时代早期遗址出土的42个黄牛进行了线粒体DNA分析,并结合现代黄牛线粒体DNA数据以及考古学文化对中国黄牛的起源、传播路径及其与早期文明的关系进行了讨论。在青铜时代早期,中国北方古代黄牛均为普通牛,未见瘤牛。古代黄牛主要由T2,T3和T4构成,近东起源的T3世系在古代黄牛中占统治地位,频率高达81.0%。近东起源的普通牛可能随着早期人群的迁徙经过两条路线进入中国。 相似文献
50.
苯并芘对褐菖鲉肝细胞DNA交联的影响 总被引：2，自引：0，他引：2
以褐菖鲉（Sebastiscus marmoratus）为实验材料,设定苯并芘[B（a）P]的注射剂量梯度分别为0.00、0.05、0.50、5.00 mg/kg,分别于实验的第0、3、6天对每一条鱼进行腹腔注射,于第1、4、7天取样,测定胆汁中的B（a）P及其代谢物含量.采用荧光检测法检测B（a）P染毒后褐菖鲉肝细胞DNA-DNA交联（DDC）交联系数的变化,并用KC l-SDS沉淀法检测DNA蛋-白质交联（DPC）交联系数的变化.结果表明：（1）经注射染毒后鱼体胆汁中的B（a）P及其代谢物含量蓄积程度存在着明显的剂量效应和时间效应;（2）B（a）P的注射剂量分别为0.05、0.50 mg/kg时各时间点褐菖鲉肝细胞DDC交联系数均无显著增大（p〉0.05）,在5.00 mg/kg剂量组,随着时间延长DDC交联系数逐渐增大,第4天即有显著差异（p〈0.05）,第7天差异极显著（p〈0.01）;（3）B（a）P诱导DPC的趋势与DDC类似,但0.5 mg/kg剂量组在第7天DPC交联系数即出现显著增大（p〈0.05）.这表明B（a）P对DPC的诱导高于DDC.这为进一步研究B（a）P的遗传毒性提供了依据,并为探讨B（a）P致癌的作用机理提供了新的信息. 相似文献