白斑综合症杆状病毒（WSBV）PCR检测方法的改进及应用   总被引：7，自引：0，他引：7  

吕玲  何建国 《热带海洋》2000,19(2):90-96,T001

斑节对虾Ｐｅｎａｅｕｓ ｍｏｎｏｄｏｎ白斑综合症是由白斑综合症杆状病毒（ＷＳＢＶ）所致。患有典型斑综合症的斑节对虾,用两种提取病毒模板ＤＮＡ的方法,进行ＰＣＲ扩增：一咱是用传统的方法,即蛋白酶Ｋ,ＣＴＡＢ等消化,酚／氯仿抽提,乙醇沉淀得到ＤＮＡ;另一咱是用改进的煮沸法提取病毒ＤＮＡ。对比发现且一种方法稳定性及敏感性比前者高,重复性好。用后一种方法对病虾 的复眼进行检测,ＰＣＲ结果为阳性。应用后一种  相似文献   

室内外培养海洋单细胞微藻的生长及生化组分   总被引：4，自引：0，他引：4  

戴俊彪  吴庆余 《海洋科学》2000,24(6):29-32

利用现有的螺旋灌培养基地,初步尝试了对海洋单细胞微藻（球等鞭金藻Ｉｓｏｃｈｒｙｓｉｓ ｇａｌｂａｎａ）的大规模室外培养,研究了藻细胞在室内外不同培养条件下的生长规律,并对其生化成分进行了分析,发现实验藻种对培养条件表现出一定的适应性。在室外条件下,细胞内脂类、蛋白质的含量都有较大的下降,分别从细胞干后的１７．０４５％和４．４１２％下降为９．７４６％和２．２５４％。与此同时,细胞内糖类含量却大大增加  相似文献   

采用UPPCR-SSCP技术快速鉴定水产养殖病原性弧菌的研究   总被引：8，自引：0，他引：8  

彭宣宪  周樱  王三英  章跃陵 《台湾海峡》2000,19(4):460-463,T001

采用通用引物PCR配合SSCP分析即UPPCR－SSCP技术,对弧菌科弧菌属中的副溶血弧菌、溶藻酸弧菌、费尼斯弧菌、鳗弧菌、哈维氏弧菌的16S－RNA基因进行检测。结果发现,UPPCR－SSCP技术能较好地鉴别细菌的不同种,但对同种不同株细菌的区分较困难。认为PCR－SSCP是将病原菌至种的有力工具。上研究对水产养殖病原菌的快速诊断与及时防治有重要意义。  相似文献   

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(福建株)基因组的克隆   总被引：2，自引：0，他引：2  

吴昊  徐丽美  杨丰 《台湾海峡》2008,27(2):147-151

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖和野生对虾的重要病原之一.目前,GenBank已收录了分离自夏威夷、加利福尼亚、泰国、中国台湾等地的IHHNV全长或部分基因组序列.虽然中国大陆在养殖对虾中也普遍检测到了IHHNV,但未见其基因组序列报道.本文首先利用DNA末端加尾和嵌套PCR克隆了IHHNV基因组两末端序列,并根据测定的末端序列设计引物,PCR扩增出中国福建株IHHNV基因组序列.  相似文献   

东海原甲藻线粒体细胞色素b(Cytb)基因的定量检测   总被引：3，自引：0，他引：3  

赵丽媛  于志刚  甄毓  米铁柱 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2009,39(3)

建立了检测东海原甲藻线粒体细胞色素b(Cytb)基因mRNA含量的实时荧光定量PCR方法.以甲藻Cytb基因的简并引物扩增得到984 bp长的东海原甲藻Cytb基因片段,经克隆、测序,制备并纯化质粒.以光度法测定质粒浓度并作为标准品.对上述基因片段,利用PRIMER EXPRESS 3.0 设计引物,以梯度稀释的质粒标准品进行定量PCR反应,以SYBR Green I为荧光染料,制作标准曲线,得到基因拷贝数X与Ct值的关系为:Ct=-3.50 lg X+39.35(相关系数r为0.999).通过对不同生长时期的东海原甲藻样品的Cytb基因mRNA含量检测,发现该基因的表达量较稳定,平均值为(45.4±4.7)拷贝/细胞,受生长状态影响不大,可作为实时荧光定量PCR的内参基因.  相似文献   

福建沿海巨蛎属牡蛎的主要种类及其分布   总被引：4，自引：0，他引：4  

杜玄  郭希明  钱鲁闽 《台湾海峡》2009,28(3):399-404

本实验采用了多重种类特异性PCR（multiplex species—specific PCR）技术，研究了巨蛎属（Crassostrea）牡蛎主要种类在福建沿海的分布．从沿海11个采样地点共采集了657个野生牡蛎样本，随机抽取了327个牡蛎样本进行基因组DNA的提取和线粒体COI基因的鉴定，结果发现200个个体为葡萄牙牡蛎（Crassostrea angulata），101个个体为近江牡蛎（Crassostrea ariakensis），20个个体为熊本牡蛎（Crassostrea sikamea），6个个体为香港巨牡蛎（Crassostrea hongkongensis）．此次实验中未发现长牡蛎（Crassostrea gigas）．结果表明，福建沿海有葡萄牙牡蛎、近江牡蛎、熊本牡蛎和香港巨牡蛎4种巨蛎属牡蛎分布．  相似文献   

羊鲍(Haliotis ovina)和耳鲍(H.asinina)MtDNA COⅠ和COⅡ基因片段序列的比较研究          下载免费PDF全文

黎中宝 《海洋与湖沼》2008,39(2):168-173

采用基因测序的方法,对我国海南产的羊鲍和耳鲍两个自然种群的COⅠ和COⅡ基因片段进行了PCR扩增和测序。结果表明,羊鲍和耳鲍COⅠ基因片段的核苷酸序列均为193bp,4种碱基组成非常相似,且其A T的含量也非常相似,分别为45.08%和45.60%。羊鲍和耳鲍COⅠ基因片段的核苷酸序列之间有29bp的差异,其中有8处发生碱基颠换,21处发生碱基转换,差异为15.03%,同源性为84.97%;羊鲍和耳鲍COⅡ基因片段的核苷酸序列均为157bp,羊鲍和耳鲍4种碱基组成差异较大,且其A T的含量也不同,分别为59.24%和55.41%。羊鲍和耳鲍COⅡ基因片段的核苷酸序列之间有19bp的差异,其中3处发生碱基颠换,16处发生碱基转换,达到12.10%的差异,同源性为87.90%。分子变异分析表明羊鲍和耳鲍物种间的变异组成为0.50,变异百分数为100.00,羊鲍和耳鲍物种间的遗传分化显著(FST=1,P<0.001)。  相似文献   

近海水域病原菌多样性研究进展     

赖迎迢  王颖  石存斌  吴淑勤 《海洋湖沼通报》2008,(4)

水产动物病原菌广泛分布于近海,不但影响海水养殖业的发展、海产品的质量安全,甚至还威胁到人类公众健康,因此,开展近海水域病原菌多样性的研究,对于海水养殖业的可持续发展及人类健康都具有重要意义。文章综述了近海水域水产动物病原菌多样性研究主要方法的原理、特点以及局限性,介绍了16S rRNA序列分析、分子杂交、指纹图谱等分子生物学技术,阐述了实时荧光定量PCR、竞争定量PCR等定量研究技术的应用,展望了病原菌多样性研究的发展趋势是原位、快速、高通量、灵敏、多技术联合和准确定量。  相似文献   

一株产褐藻酸多糖的海洋假单胞细菌Pseudomonas sp.QDA的筛选和鉴定   总被引：9，自引：0，他引：9  

韩文君  路新枝  肖琳  于文功 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2004,34(1):60-64

根据已获褐藻酸多糖生物合成基因簇中褐藻胶裂解酶基因(αlgL)的序列设计特异性引物，利用PCR技术从海洋微生物中筛选到1株能够分泌胞外多糖的细菌。采用形态学观察和16S rDNA序列分析鉴定该菌株，结果为假单胞属细菌，命名为Pseudomonas sp.QDA；系统发育树显示该菌株与P.putida亲缘关系最近。菌株产生的胞外多糖可被褐藻胶裂解酶(AlgL)降解，并在紫外234nm处检测到特征性吸收，初步证明含有褐藻酸多糖。  相似文献   

Abundance and distribution of dinoflagellate cysts in Xiamen Western Harbor     

CAO Wenqing  LIN Yuanshao  FANG Luping 《海洋学报(英文版)》2004,23(2):347-357

In a grid investigation, dinoflagellate cysts were collected from sediments in Xiamen Western Harbor in May of 2000, from which five species of cysts were identified: Alexandrium tamarensis, A. minutum, Lingulodinium polyedra, Gonyaulax scrippsae and Gymnodinium catenatum, account for about 21% in the species composition. The quanti-tative analysis of the sediments shows that the number of dinoflagellate cysts varies from 51 to 256 cysts/g of sediment, the highest value (>200 cysts/g) being recorded at the stations of the central part of the bay, while the lowest (<100 cysts/g) at the bay mouth. A good linear relationship is found between cyst amount and fine-grained sediments. Complex physiognomies on the seabed, topographty in the bay and weak water exchange are the main factors not only in cyst accumulation but also in their distribution pattern, and have resulted in the difference in cyst densities between the inner bay and the outer bay in the harbor.  相似文献