Assessing the Germplasm of Laminaria （Phaeophyceae） with Random Amplified Polymorphic DNA （RAPD） Method     

赫英俊  邹俞萍  王晓东  郑治国  张大明  段德麟 《中国海洋湖沼学报》2003,21(2):141-148

Eighteen gametophytes including L.japonica ,L.ochotensis and L.longissima,were verified with random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique.Eighteen ten-base primers were chosen from 100 primers selected for final amplification test.Among the total of 205 bands amplified ,181(88.3%) were polymorphic ,The genetic distance among different strains ranged from 0.072 to 0.391,The dendrogram constructed by unweighted pair -group method with arithmetic(UPGMA) method showed that the female and male gamtophytes of the same cell lines could be grouped in pairs respectively,It indicated that RAPD analysis could be used not only to distin-gusih different strains of Laminariz ,but also to distinguish male and female gametophyte within the same cell lines,There is ambiguous systematic relationship if judged mereely by the present data It seems that the use of RAPD marker is limited to elucidstion of the phylogenetic relationship among the species of Laminaria.  相似文献   

Phaeocystis globosa与Phaeocystis antarctica叶绿体psbA基因的比较   总被引：3，自引：0，他引：3       下载免费PDF全文

杨泽民  章群  谢数涛  韩博平  吕颂辉  Hodgkiss 《海洋科学》2005,29(1):24-28

测定了2株球形棕囊藻Phaeocystis globosa P1、P2的psbA基因序列。发现得到的2个序列完全相同。以P2序列对比分析了P．globosa和P．antarctica的psbA基因在DNA序列、氮基酸序列和RNA二级结构上的差异性，发现2种棕囊藻psbA基因DNA序列和氨基酸序列非常保守，无插入／缺失，其核苷酸和氨基酸变异率分别为1．88％和1．13％。与核基因核苷酸的碱基替换不同，psbA基因核苷酸的碱基替换主要发生在密码子的第1位上。且不引起氨基酸的变化，引起氨基酸变化的碱基替换都发生在密码子的第2位和第3位上。在RNA二级结构上两序列的1～4茎环结构完全相同，表现出明显的棕囊藻属的特异性，其它结构区域差异较大。种间差异表现明显。由于psbA基因DNA序列和氨基酸序列非常保守，可能不适宜棕囊藻属的系统发育分析。但其RNA二级结构可能对于棕囊藻的分子分类有一定的参考价值。  相似文献   

雨生红球藻β-胡萝卜素酮化酶基因的cDNA和基因组DNA克隆及序列分析     

滕长英  张立  秦松  曾呈奎 《海洋科学》2006,30(8):20-27

根据已知的β-胡萝卜素酮化酶(β-carotene ketolase,BKT)的cDNA序列设计引物,利用长距离PCR扩增获得了bkt基因的cDNA完整编码片段及基因组DNA片段,并对这些片断进行了序列测定。cDNA和基因组DNA比对结果表明该基因至少包括5个内含子,它们的剪切位点皆符合GU-AG规律。在比对结果中同时还发现一个19bp的短序列重复,该重复序列在bkt的cDNA和基因组DNA上都发生了多次重复,推测在BKT的表达调控中可能具有一定功能。另外,在序列比对过程中还发现本实验所获得的cDNA和基因组DNA序列与前人报道的cDNA序列之间都存在多处单碱基差异和19bp的短序列差异。  相似文献   

甲壳动物线粒体DNA的研究   总被引：4，自引：0，他引：4  

方李宏  薛俊增  董双林 《海洋湖沼通报》2004,199(2):59-65

对于甲壳动物的分子生物学研究特别是其中与进化相关的研究工作目前主要围绕着线粒体基因序列开展。在近20年的生物线粒体序列研究过程中线粒体全序列的数量经历了一个飞速发展的过程，但甲壳动物中仅有8个物种的线粒体全序列完成测序。通过对NCBI(National Center for Biotechnology Infomation)的GenBank中数据的分析我们发现线粒体基因序列的数量占全部序列数的近一半。甲壳动物线粒体序列的研究主要围绕着12s rRNA、16s rRNA和COI进行，国内的相关研究处于起步阶段。  相似文献   

Phylogenetic analysis of Pectinidae(Bivalvia) based on the ribosomal DNA internal transcribed spacer region     

HUANG Xiaoting  BI Ke  HU Jingjie  HU Xiaoli  BAO Zhenmin 《海洋学报(英文版)》2007,26(6):83-90

The ribosomal DNA internal transcribed spacer (ITS) region is a useful genomic region for understanding evolutionary and genetic relationships. In the current study, the molecular phylogenetic analysis of Pectinidae (Mollusca: Bivalvia) was performed using the nucleotide sequences of the nuclear ITS region in nine species of this family. The sequences were obtained from the scallop species Argopecten irradians, Mizuhopecten yessoensis, Amusium pleuronectes and Mimachlamys nobilis, and compared with the published sequences of Aequipecten opercularis, Chlamys farreri, C. distorta, M. varia, Pecten maximus, and an outgroup species Perna viridis. The molecular phylogenetic tree was constructed by the neighbor-joining and maximum parsimony methods. Phylogenetic analysis based on ITS1, ITS2, or their combination always yielded trees of similar topology. The results support the morphological classifications of bivalve and are nearly consistent with classification of two subfamilies (Chlamydinae and Pectininae) formulated by Waller. However, A. irradians, together with A. opercularis made up of genera Amusium, evidences that they may belong to the subfamily Pectinidae. The data are incompatible with the conclusion of Waller who placed them in Chlamydinae by morphological characteristics. These results provide new insights into the evolutionary relationships among scallop species and contribute to the improvement of existing classification systems.  相似文献   

褐牙鲆(♀)、夏鲆(♂)及其杂交子一代线粒体16S rDNA序列遗传特性的初步研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

徐晖  肖志忠  孔晓瑜  李军  董晓丽 《热带海洋学报》2007,26(5):60-63

以线粒体16S rRNA基因部分片段为代表研究雌褐牙鲆Paralichthys olivaceus、雄夏鲆P. dentatus及其杂交子一代间线粒体DNA的遗传特性。母本与父本序列差异较大,属种间差异,在590个位点中有28个变异位点,而且全部为简约信息位点。使用同一对引物扩增亲本与杂交子代,在杂交子代中未检测到父本的线粒体DNA类型,11个处于两种生长阶段的杂交样本仅检测到一种单倍型,而且与母本的一个单倍型为同一种,表明褐牙鲆与夏鲆杂交线粒体DNA遵循母系遗传规律。  相似文献   

Identification of Epinephelus malabaricus and Epinephelus coioides using DNA markers     

WANG Shifeng  DU Jiaying  WANG Jun  DING Shaoxiong 《海洋学报(英文版)》2007,26(1):122-129

1 IntroductionBothEpinephelus malabaricusandE. coioidesbelong to the genusEpinephelus(Perciformes: Ser-ranidae: Epinephelinae).They are warm water reeffishes that have similar distribution ranges as well assimilar morphological characteristics, which have…  相似文献   

6个虾种基因组DNA多态性分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

许玉德  孙晟 《海洋科学》2001,25(1):9-11

采用RAPD方法检测了罗氏沼虾（Macrobrachium rosenbergii)、绿须虾（Aristeus virilis)、长毛对虾（Penaeus penicillatus)、日本对虾（P.japonicus)、斑节对虾（P.monodon)和周氏新对虾（Metapenaeus joyneri)等6个虾种的基因组DNA的多态性。用20个随机引物扩增得到492个DNA片段，根据这些片段的共享度计算出遗传距离并构建系统树。所得结果从DNA水平上反映出虾类在科属种不同分类阶元亲缘关系的远近，并为虾类现行的分类系统提供了分子生物学依据。  相似文献   

四色荧光标记DNA自动测序中一例典型错读码的校正   总被引：3，自引：0，他引：3  

马洪明  路新枝  王勇 《海洋科学》2002,26(3):10-13

ＤＮＡ测序是现代分子生物学研究中的重要技术。随着人类基因组计划的实施 ,ＤＮＡ测序技术虽然在原理上没有新突破 ,仍然依赖于Ｓａｎｇｅｒ的酶法 ,但在不断提高自动化程度、降低成本方面取得了很大的进展 ,测序效率目前已有很大提高。大规模测序一个碱基的成本从１９８６年的０．５美元降到目前的约７美分。目前各种ＤＮＡ自动测序技术都是在荧光标记技术的基础上发展起来的。采用荧光标记的自动测序仪已在各个领域被广泛应用。四色荧光标记自动测序采用４种具有不同发射波长的荧光染料标记由聚合链终止反应产生的一系列终止片段 ,经过聚…  相似文献   

蛋白质组学的研究概况及其在海洋生物学中的应用   总被引：7，自引：0，他引：7       下载免费PDF全文

高政权  王广策  曾呈奎 《海洋与湖沼》2003,34(3):334-344

随着DNA序列测定技术的飞速发展，人们可以在很短的时间内获得某种生物基因组的全序列。生物体的生命活动主要依赖于基因组的产物——蛋白质组，但是蛋白质组的研究相对于基因组来说却要复杂得多。蛋白质组技术是在细胞内整体蛋白质水平上进行研究，从蛋白质整体活动的角度来研究生命活动的规律。综述了蛋白质组和蛋白质组学出现的背景、起源、概念、研究技术、研究内容、面对的挑战、开展该项研究的意义、陆生动植物和微生物蛋白质组学的研究进展及海洋生物蛋白质组学的研究概况。目前，普通生物方面的蛋白质组工作开展得较多，海洋生物方面却相对滞后。种种迹象表明，开展海洋生物蛋白质组学研究，对揭示生命的奥秘、促进海洋资源的开发都有重大的推动作用。  相似文献