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采用PCR及T-A克隆技术，从基因组DNA成功克隆三角鲂、太湖鲂鲌、太湖鲂鲌F2代含完整阅读框的生长激素基因全序列，经测序拼接获得序列全长分别为6009、6042和6058bp，转录单元长分别为2049、2014和2045bp。三种群体的GH基因序列均包括五个外显子、四个内含子及5''侧翼区和3''侧翼区；编码氨基酸序列均为633bp，编码210个氨基酸。对3个目14种鱼类进行同源性及系统发育分析发现，太湖鲂鲌F2代与其祖父母的遗传距离相比亲本较近。另取10尾太湖鲂鲌F2代，对其进行GH基因编码区SNPs筛选，共得到7处SNPs，其中有3处位点的突变导致其氨基酸序列发生了明显的变化；对其蛋白质结构分析发现，突变后的氨基酸残基导致蛋白质二级结构发生改变。我们将该10尾个体按体重分为小个体组和大个体组，经组织表达分析发现，大个体组中的个体具有较高的转录水平，进一步分析发现其氨基酸残基有所不同。 相似文献
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A series of experiments was carried out to study the flow behaviour behind a rotationally oscillating cylinder at a low Reynolds number (Re=300) placed in a recirculation water channel. A stepper motor was used to rotate the cylinder clockwise- and- counterclockwise about its longitudinal axis at selected frequencies. The particle image velocimetry (PIV) technique was used to capture the flow field behind a rotationally oscillating cylinder. Instantaneous and time-averaged flow fields such as the vorticity contours, streamline topologies and velocity distributions were analyzed. The effects of four rotation angle and frequency ratios Fr (Fr=fn/fv, the ratio of the forcing frequency fn to the natural vortex shedding frequency fv) on the wake in the lee of a rotationally oscillating cylinder were also examined. The significant wake modification was observed when the cylinder undergoes clockwise-and-counterclockwise motion with amplitude of π, especially in the range of 0.6≤Fr≤1.0. 相似文献
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凡纳滨对虾的主要选育目标分为两个方面: 一是培育具有较强抗病、抗逆性的“高抗系”(GK),二是培育具有快速生长特性的“快大系”(KD)。然而, 国内缺少针对这两个选育群体的遗传多样性特别是基因组近交水平的调查分析研究。基于液相芯片“黄海芯1号”(55 K SNP)的基因分型数据, 首次分析了GK (1 064尾个体)和KD (564尾个体)选育群体的遗传结构和遗传多样性, 调查了连续性纯合片段(ROH)的基因组分布特征, 并重点评估了两个群体的基因组近交水平。PCA及进化树分析表明GK及KD群体可明确分层, 亲缘关系热图表明KD群体内个体间的亲缘关系比GK群体更近。GK群体包括的家系数量更多, 导致其遗传多样性高于KD群体; 两群体间的Fst为0.09, 存在中等遗传分化。GK和KD群体每个ROH的平均长度分别为(1.70±0.34) Mb和(1.65±0.38) Mb, 每个样本ROH的平均数量分别为1.98±1.30和2.07±1.37。GK和KD群体0.8~1.25 Mb长度的ROH占比分别为11.41%和19.17%, 表明KD群体的选育历史比GK群体更长。两个群体>2.25 Mb长度的ROH片段占比分别为10.26和9.74%, 表明两个群体短期内未发生近亲交配。七种基因组近交系数评估结果表明, KD群体的近交水平高于GK群体。不依赖基础群体等位基因频率的FROH和FHOM方法可准确地评价育种群体的真实近交水平, 而FVR1、FYA1和FLH1等依赖基础群体等位基因频率的方法可以用来比较群体及个体间的相对近交水平。上述结果为准确地评估育种群体的近交水平和优化育种方案提供了重要参考依据。 相似文献
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Photosynthetic activity and antioxidative response of seagrass Thalassia hemprichii to trace metal stress 总被引：1，自引：0，他引：1
This study concerned the accumulation of trace metals in tissues of seagrass (Thalassia hemprichii) exposed to various concentrations of Zn2++, Cd2++, Pb2++ and Cu2++ for 10 d, and the effect of excessive metals on quantum yield (ΔF=Fm'), photosynthetic pigments and antioxidative enzymes like superoxide dismutase (SOD), guaiacol peroxidase (POD) were also examined. Cadmium was the most highly accumulated metal. Meanwhile, high metals levels led to a remarkable breakdown of photosynthetic parameters. Especially, ΔF=Fm', chlorophyll and carotenoid were significantly low during prolonged Cu exposure. Besides, ΔF=Fm' was more severely depressed by Cu and Zn than Pb and Cd. However, T. hemprichii had positive response by increasing the activity of SOD and POD. The results indicate that T. hemprichii is the most sensitive to Cu, and the antioxidative protection mechanisms of T. hemprichii are more efficiently activated to avoid damage of Zn, Cd and Pb stress. Finally, due to the high Cd-accumulation and strong Cd-tolerance capacity, T. hemprichii can be used for phytoremediation in Cd-contaminated areas. 相似文献
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2014年冬季西太平洋浮游植物光合作用特征 总被引：2，自引：1，他引：1
利用浮游植物荧光仪Phyto-PAM测量了西太平洋浮游植物最大光化学量子产量、快速光曲线系数,结合相应的生态因子,对西太平洋浮游植物进行了原位光合作用特征研究。结果表明：西太平洋走航断面表层浮游植物最大光化学量子产量Fv/Fm值基本在0.2以下,而DY（大洋）断面Fv/Fm平均值仅为0.16,光能利用效率α的变化范围为0.007-0.117,平均值为0.039;相对最大电子传递速率rETRmax变化范围为6.8-113.4（μmol/（s·m2））,平均值为32.72（μmol/（s·m2））;饱和光强Ek的变化范围为60.3-1662.7（μmol/（s·m2））,平均值为846.83（μmol/（s·m2））。DY断面Fv/Fm最大值水层与DCM层（叶绿素最大层）相吻合,既保护了浮游植物光反应中心不受强烈光辐射影响,又支持了DCM层浮游植物相对较强的光合作用和对整个水体初级生产力的贡献率。DY断面浮游植物具有极低的光能利用效率却需要较高的光强来达到光饱和,导致这种生活环境下浮游植物处于一种低活衰老的状态,这是造成某些大洋海区低生产力现象出现的原因之一。 相似文献
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虫黄藻是珊瑚礁生态系统中最主要的初级生产者，并在珊瑚礁的建造过程中起着关键作用。为探究虫黄藻对温度和光照的生理响应，本研究以E型虫黄藻（Symbiodinium voratum）为实验对象，通过室内培养，并结合谢尔福德耐受性定律建立了基于温度的虫黄藻生长速率的耐受性模型。结果显示：E型虫黄藻在光强90μE培养下，最适生长温度为22.56℃，适温范围为16.72—28.40℃；温度培养实验中，23℃时，虫黄藻中有机碳（C）、氮（N）积累最多； 27℃时，虫黄藻PSⅡ的原初光能转化效率（Fv/Fm）显著高于其余两个温度组；光照培养实验中，E型虫黄藻在温度23℃培养下，光强的适宜范围为100—200μE；并通过提高细胞内叶绿素a含量和Fv/Fm两种方式应对外界光照不足。 相似文献
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对烟颗粒的光散射进行模拟计算是研究火灾烟颗粒光散射特性的重要手段,目前对于火灾烟颗粒光散射的数值计算多采用球形或椭球模型.实际上,火灾烟颗粒的形貌与球形和椭球均存在着显著差异.扫描电子显微镜图像表明,烟颗粒具有近似分形的结构.本文利用离散偶极近似方法计算了随机取向的火灾烟颗粒分形凝团以及同体积的球形颗粒的光散射Muller矩阵,并对两者的归一化Muller矩阵元素随散射角的分布进行了比较.研究表明:火灾烟颗粒分形模型和球形模型的归一化矩阵元素F11(θ)/F11相似文献
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以江苏文蛤(Meretrix meretrix)为研究对象,采集红壳色文蛤原种、黄壳色文蛤原种、红壳色文蛤选育F1、红壳色文蛤选育F2 4个群体,检测其主要非挥发性鲜味物质成分单磷酸腺苷(AMP)、单磷酸鸟苷(GMP)、次黄嘌呤核苷酸(IMP)、琥珀酸、游离氨基酸、无机离子(Na~+、K~+、Cl~–、PO_4~(3–))的含量,并通过味道强度值(TAV)评价其呈味作用。鉴于核苷酸与氨基酸在呈味方面的协同效应,采用味精当量(EUC)评价不同文蛤群体的鲜味品质。结果表明,文蛤软体组织中AMP、琥珀酸、谷氨酸、精氨酸、丙氨酸、Na+、K~+、Cl~–的TAV值大于1,是文蛤鲜味的主要贡献者;红壳色文蛤原种的鲜味强度最大(4.92 g/100g),其子代红壳色文蛤F1(4.08 g/100g)、红壳色文蛤F2(4.09 g/100g)稍有降低,但仍显著高于黄壳色文蛤原种(3.34 g/100g)(P0.05),表明江苏红壳色文蛤在鲜味品质方面具有相对稳定的较高品质。 相似文献
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采用通用引物对辽宁盘锦、辽宁大连、山东日照的3个地理群体黑龙江河蓝蛤(Potamocorbula amurensis)COI和16S r RNA序列进行扩增、测序分析,得到30条658bp的COI基因部分序列和27条450 bp的16S r RNA基因部分序列。其中COI和16S r RNA基因部分序列T、C、A、G和A+T的平均含量分别为45.4%和32.0%、13.5%和13.3%、20.7%和29.3%、20.4%和25.3%、66.1%和61.3%,AT含量高于GC含量,这与其他软体动物门动物的COI和16S r RNA的观测结果相近。COI和16S r RNA分别检测到了24个单倍型、43个核苷酸多态位点和9个单倍型、19个核苷酸多态性位点。AMOVA分析表明,3个群体间COI和16S r RNA部分基因总遗传分化系数分别为Fst=0.0090(P0.001)和Fst=0.0674(P0.001),群体内遗传分化远大于群体间、群体内存在较高的遗传分化。用NJ法构建分子进化树,3个地理群体的黑龙江河蓝蛤聚为一个族群,有少数个体和其他群体的个体聚在一起。 相似文献
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Use of Cell-Specific PAM-Fluorometry to Characterize Host Shading in the Epiphytic Dinoflagellate Gambierdiscus toxicus 总被引：1，自引：0，他引：1
Abstract. Cell‐specific fluorescence characteristics were used to characterize the light tolerance of the toxic benthic dinoflagellate Gambierdiscus toxicus. The fluorescence parameter Fv : Fm was measured using pulse amplitude modulation (PAM) fluorometry on individual cells collected from foliose red algae growing in the sub‐tidal margin of South Water Cay, Belize. Samples were collected over several days during sunny and cloudy conditions and compared to samples incubated in situ. The data from individual cells were used to generate both Fv : Fm frequency histograms and averages. Maximum individual cell values of Fv : Fm reached 0.81 in pre‐dawn samples, a value near the theoretical maximum for PAM fluorometry. In field samples from macroalgal hosts, average Fv : Fm values declined only slightly during the day, but cells incubated in bottles under 47 % incident sunlight showed a significant mid‐day depression. In freshly collected samples, near‐maximum Fv : Fm values could be found in individual cells during the entire day; however, the frequency histograms indicated a greater range in Fv : Fm values during the afternoon than in the morning. In contrast, cultures of G. toxicus showed a tight distribution around a mean. Field samples showed a rapid recovery to near‐maximum Fv : Fm within 2 min when assayed using a standardized actinic light series. Similar results were obtained in laboratory cultures of G. toxicus grown at 73 µmol photons · m‐2 · s‐1, but not at 383 µmol photons · m‐2 · s‐1. These data provide empirical support for suggestions that G. toxicus exploits the three‐dimensional structure of the algal host thallus to minimize light exposure. This strategy permits G. toxicus, a high‐light intolerant species in culture, to thrive in shallow, well‐lit tropical seas. It may also partially explain the observed preference of G. toxicus for complex, foliose macroalgae as hosts. 相似文献
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基于线粒体16S rRNA 基因研究5 个栉江珧野生群体的遗传多样性 总被引：1，自引：0，他引：1
采用通用引物对山东长岛、文登、日照、广东湛江和海南三亚等5个地理群体栉江珧(Atrina pectinta)16S rRNA序列进行扩增、测序分析,得到59条441bp的核苷酸序列.其中T、C、A、G和A+T的平均含量分别为29.91%、17.41%、25.74%、26.94%及55.65%, AT含量高于GC含量,共检测到了9个单倍型和26个核苷酸多态位点.群体多样性分析表明,文登群体具有较高的遗传多样性水平.AMOVA 分析表明,五群体间总遗传分化系数Fst =0.5007(P<0.001),群体间遗传分化略大于群体内、群体间存在较高的遗传分化.基于群体间遗传距离构建NJ和UPGMA分子进化树,5个地理群体的栉江珧聚为两个支,长岛、文登、日照群体聚为一支,海南和湛江群体聚为另一支. 相似文献
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为了阐明南中国海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统进化情况,利用聚合酶链式反应扩增目的产物,将其连接到T载体后,并对其序列进行测定,共得到9种裸胸鳝属鱼类线粒体16S ribosomalDNA(16S rDNA)基因的部分序列,采用多个生物软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算了Kimura2-parameter遗传距离,转换/颠换比等遗传信息指数,下载基因库中16SrDNA基因的同源序列,以鳗鲡属(Anguilla)的花鳗鲡(Anguilla marmorata)为外群构建NJ(Neighbore-Joining)、MP(MaximumParsimony)和ME(Minimum Evolution)系统进化树。根据所得分子数据并结合形态学特征推论如下:(1)在所研究的10种裸胸鳝鱼中共有516个位点、其中143个核苷酸位点存在变异(27.7%);(2)序列变异的转换/颠换比值的平均值为3.441;相对遗传距离数据表明斑颈裸胸鳝(G. margaritophorus)和网纹裸胸鳝(G. reticularis)差异最大(0.177),褐祼胸鳝(G. hepaticus)与布雷顿氏裸胸鳝(G. breedeni)差异最小(0.022);(3)NJ树、ME树表明裸胸鳝属内部存在3个平行进化的姐妹分支,分支内部的种类组成与地理分布无关。 相似文献
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根据2018年7月、11月和2019年1月、4月对广东考洲洋牡蛎养殖海域进行4个季节调查获得的pH、溶解无机碳(DIC)、水温、盐度、溶解氧(DO)及叶绿素a(Chla)等数据,估算该区域表层海水溶解无机碳体系各分量的浓度、初级生产力(PP)、表层海水CO2分压[p(CO2)]和海-气界面CO2交换通量(FCO2),分析牡蛎养殖活动对养殖区碳循环的影响。结果表明:牡蛎养殖区表层海水中Chla、DIC、HCO3–和PP显著低于非养殖区;养殖淡季表层海水中pH、DO、DIC、HCO3–、和CO32–显著大于养殖旺季,养殖旺季的p(CO2)和FCO2显著大于养殖淡季。牡蛎养殖区表层海水夏季、秋季、冬季和春季的海-气界面CO2交换通量FCO2平均值分别是(42.04±9.56)、(276.14±52.55)、(–11.59±18.15)和(–13.02±6.71)mmol/(m2·d),冬季各站位FCO2值离散度较大,其中位数是–10.73mmol/(m2·d)。在全年尺度,表层海水p(CO2)及FCO2与水温呈显著正相关,与盐度呈显著负相关。在非养殖区,浮游植物光合作用可能对影响表层海水p(CO2)及FCO2起主导作用。养殖牡蛎钙化、呼吸作用等生理因素释放的CO2对表层海水p(CO2)及FCO2未产生显著影响。考洲洋养殖海域养殖旺季为CO2的源,养殖淡季整体为CO2的弱汇。 相似文献
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Effect of native and invasive cordgrass on Macoma petalum density, growth, and isotopic signatures 总被引：1，自引：0，他引：1
Ecosystem engineers can influence community and ecosystem dynamics by controlling resources, modifying the flow of energy or biomass, or changing physical characteristics of the habitat. Invasive hybrid cordgrass (Spartina alterniflora × Spartina foliosa) is an ecosystem engineer in salt marshes in San Francisco Bay, California, U.S.A. that raises intertidal elevations and may be either increasing C4 plant carbon input into food webs or tying up carbon in a form that is not usable by consumers. A manipulative experiment compared abundance, growth, and stable isotope (δ13C and δ15N) composition of the clam Macoma petalum (=M. balthica) among native marsh, hybrid Spartina, and mudflats in central San Francisco Bay. We found higher densities (individuals m−2) of M. petalum on mudflats compared to either native or hybrid Spartina (p < 0.001). Macoma petalum shell growth was significantly greater in mudflats than in either vegetation type in 2002 (p = 0.005) but not 2003. Differences in shell growth between native and hybrid Spartina were not significant. Stable isotope results showed differences between habitats in δ13C but not δ15N. Carbon signatures of M. petalum placed in Spartina were much more depleted than the isotopic signature of Spartina. Neither native nor hybrid Spartina appears to be a significant carbon source for M. petalum in San Francisco Bay, and we found no evidence that hybrid Spartina contributes carbon to M. petalum beyond what is provided by S. foliosa, despite the hybrid's much greater biomass. Our results show that loss of mudflat habitat, rather than increased input of C4 carbon, is the greatest effect of the invasion of hybrid Spartina on M. petalum. 相似文献
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采用PCR扩增和序列测定等技术,对脊尾白虾3个野生群体共计58个个体的线粒体16SrRNA基因片段进行初步研究。结果表明,在获得的长度为509bp核苷酸序列中,共检测到7个变异位点、8种单倍型,除象山湾群体外其它两个群体遗传多样性水平都较低。AMOVA分析表明,象山湾与莱州湾群体有显著的遗传差异,其余群体间的遗传差异不显著。另外,将本研究所得序列与GenBank中长臂虾科11个种的16SrRNA基因片段序列进行比较后,发现其聚类关系与传统分类略有不同,并依据16SrRNA序列变异百分比推测了长臂虾科12个种的大致分化时间。 相似文献
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滤食性贝类在生态系统中可通过自身生理活动促进系统的物质循环和能量流动,进而影响养殖环境。为从养殖系统底质环境角度为综合养殖系统优化提供依据,建立了4个实验生态系统,即在三疣梭子蟹-日本囊对虾养殖系统中混养3个不同密度的缢蛏(由低到高分别表示为PMB1,PMB2,PMB3),并以三疣梭子蟹-日本囊对虾养殖系统(PM)为对照。通过对不同养殖系统底泥理化性质及小型底栖动物丰度、生物量的比较分析,探究缢蛏不同混养密度对养殖系统底质环境的影响。结果显示,总体而言,试验期间缢蛏高密度混养系统PMB3底泥pH与氧化还原电位(ORP),显著高于其他系统,而底泥有机质含量显著低于其他系统。从小型底栖动物群落物种组成来看,不同养殖系统中线虫在丰度上占主要优势,占总丰度的35.9%~42.7%;介形类在生物量上占最大优势,占总生物量的74.2%~81.1%,PMB3总丰度和总生物量显著高于其他系统。较高混养密度下,缢蛏能通过滤食残饵、粪便等有机物减少底泥有机物质的积累,改善底质环境,提高小型底栖动物丰度和生物量。本试验条件下,根据养殖系统底质环境变化特征,缢蛏放养密度34.7×104 ind./hm2为最优放养密度。 相似文献
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利用生物压片技术,通过形态学和解剖学方法,对采自我国沿岸海洋的仙菜科红藻(Ceramiaceae,Rhodophyta)进行了分类学研究,发现了我国仙菜科新记录属——盖氏藻属(新拟名)Gayliella T.O.Cho,L.McIvor et S.M.Boo。该属目前在我国共有5个种,即短毛盖氏藻(新拟名)Gayliella pmbriatum (Setchell et N. L. Gardner). T. O. Cho et S. M. Boo、优美盖氏藻(新拟名) Gayliella βaccidum (Kützing) T. O. Cho et L. McIvor、泰式盖氏藻(新拟名) Gayliella taylorii (E. Y. Dawson) T. O.Cho et S. M. Boo、马沙盖氏藻(新拟名) Gayliella mazoyerae T. O. Cho, Fredericq et Hommersand和横轴盖氏藻(新拟名) Gayliella transversalis (Collins et Hervey) T. O. Cho et Fredericq,其中前3个种为由仙菜属Ceramium归并的物种,后2个为我国的新记录种。本文对此2个新记录种进行了详细的形态学描述,并讨论了它们与中国已报道的横列仙菜Ceramium gracillimum间的关系。该研究结果丰富了我国海洋仙菜科的物种多样性。 相似文献