Identification of Epinephelus malabaricus and Epinephelus coioides using DNA markers     

WANG Shifeng  DU Jiaying  WANG Jun  DING Shaoxiong 《海洋学报(英文版)》2007,26(1):122-129

1 IntroductionBothEpinephelus malabaricusandE. coioidesbelong to the genusEpinephelus(Perciformes: Ser-ranidae: Epinephelinae).They are warm water reeffishes that have similar distribution ranges as well assimilar morphological characteristics, which have…  相似文献   

6个虾种基因组DNA多态性分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

许玉德  孙晟 《海洋科学》2001,25(1):9-11

采用RAPD方法检测了罗氏沼虾（Macrobrachium rosenbergii)、绿须虾（Aristeus virilis)、长毛对虾（Penaeus penicillatus)、日本对虾（P.japonicus)、斑节对虾（P.monodon)和周氏新对虾（Metapenaeus joyneri)等6个虾种的基因组DNA的多态性。用20个随机引物扩增得到492个DNA片段，根据这些片段的共享度计算出遗传距离并构建系统树。所得结果从DNA水平上反映出虾类在科属种不同分类阶元亲缘关系的远近，并为虾类现行的分类系统提供了分子生物学依据。  相似文献   

6-磷酸山梨醇脱氢酶(gutD)基因克隆、测序和表达     

陈启伟  刘广发  邱凤英 《台湾海峡》2004,23(3):314-317

本研究根据6-磷酸山梨醇脱氢酶基因(gutD)两端序列设计引物，以假单胞杆菌(Pseudonmonas XM)的总DNA为模板通过PCR的方法克隆gutD基因并进行序列分析，将克隆得到的gutD基因与原核表达载体pBV220连接并转化大肠杆菌(Escherichia coli)JM101后检测其蛋白表达及菌株生长耐盐性。  相似文献   

斑鳢(Channa maculata)微囊藻毒素去毒相关基因sGST的克隆与序列分析          下载免费PDF全文

肖圣杰  梁旭方  廖婉琴  雷腊梅  韩博平 《海洋与湖沼》2007,38(3):234-239

采用RT-PCR技术和RACE技术成功克隆淡水鱼类斑鳢sGST基因cDNA全序列,推测得到氨基酸序列,初步分析其结构功能域及系统进化关系。结果表明,斑鳢sGST基因cDNA序列全长为898bp,编码225个氨基酸。斑鳢sGST与真鲷、金头鲷、鲽、黑头鲦、川鲽、大口黑鲈等最新定名为ρ型的sGST氨基酸同源性较高,ρ型sGST为水生生物所特有并共同占据进化树上独立的分枝;与大鼠、小鼠、人等哺乳动物sGST现有所有类型同源性均很低,并且在进化树上距离也较远,表明本研究成功克隆的sGST基因应属于ρ型,可能在鱼类等水生生物对水栖环境的适应上有重要作用。  相似文献   

四色荧光标记DNA自动测序中一例典型错读码的校正   总被引：3，自引：0，他引：3  

马洪明  路新枝  王勇 《海洋科学》2002,26(3):10-13

ＤＮＡ测序是现代分子生物学研究中的重要技术。随着人类基因组计划的实施 ,ＤＮＡ测序技术虽然在原理上没有新突破 ,仍然依赖于Ｓａｎｇｅｒ的酶法 ,但在不断提高自动化程度、降低成本方面取得了很大的进展 ,测序效率目前已有很大提高。大规模测序一个碱基的成本从１９８６年的０．５美元降到目前的约７美分。目前各种ＤＮＡ自动测序技术都是在荧光标记技术的基础上发展起来的。采用荧光标记的自动测序仪已在各个领域被广泛应用。四色荧光标记自动测序采用４种具有不同发射波长的荧光染料标记由聚合链终止反应产生的一系列终止片段 ,经过聚…  相似文献   

海浪日最大波高序列的一种标度性质   总被引：1，自引：0，他引：1  

尉华  沈正 《海洋湖沼通报》1994,(4):1-8

应用重标度分析方法研究小麦岛海洋观测站１９６１－１９８０年二十年海浪日最大波高序列时发现，该序列并不是相互独立的，而是具有记忆性和持久性，详细的论证表明分式布朗运动模型是描述海浪日最大波高序列的一个较好的模型，同时，应用分式布朗运动模型我们找到了存在于海浪日最大波高序列中的一种标度性质－累积离差（ｔ）的统计自仿射性。  相似文献   

蛋白质组学的研究概况及其在海洋生物学中的应用   总被引：7，自引：0，他引：7       下载免费PDF全文

高政权  王广策  曾呈奎 《海洋与湖沼》2003,34(3):334-344

随着DNA序列测定技术的飞速发展，人们可以在很短的时间内获得某种生物基因组的全序列。生物体的生命活动主要依赖于基因组的产物——蛋白质组，但是蛋白质组的研究相对于基因组来说却要复杂得多。蛋白质组技术是在细胞内整体蛋白质水平上进行研究，从蛋白质整体活动的角度来研究生命活动的规律。综述了蛋白质组和蛋白质组学出现的背景、起源、概念、研究技术、研究内容、面对的挑战、开展该项研究的意义、陆生动植物和微生物蛋白质组学的研究进展及海洋生物蛋白质组学的研究概况。目前，普通生物方面的蛋白质组工作开展得较多，海洋生物方面却相对滞后。种种迹象表明，开展海洋生物蛋白质组学研究，对揭示生命的奥秘、促进海洋资源的开发都有重大的推动作用。  相似文献   

中国沿海亚历山大藻(Alexandrium)核糖体rDNA部分序列分析及该藻属分子系统进化研究   总被引：4，自引：1，他引：4  

唐祥海  于仁成  颜天  王云峰  周名江 《海洋与湖沼》2006,37(6):529-535

分析了几株自南海及东海分离的亚历山大藻的rDNA部分序列信息,其中包括核糖体大亚基(LSU)rDNA的5′端D1-D2区序列,以及5.8SrDNA和ITS区序列;同时也对实验室保种的部分来自其它国家和地区的亚历山大藻相关序列进行了测序和分析,并以此作为序列分析中的参考。采用ClustalX及MEGA2软件对所得到的序列信息进行了综合分析与对比。结果表明,分离自南海的塔玛亚历山大藻(Alexandriumtamarense)和分离自东海的链状亚历山大藻(A.catenella),即便是在ITS区和LSUrDNA等高变区,其序列信息也完全一致。与基因库中搜索到的其它亚历山大藻rDNA序列信息相比较,中国沿海的塔玛/链状亚历山大藻序列更接近于塔玛复合种的“亚洲温带”基因型。对于分离自南海的另外两株未定种的亚历山大藻,通过对比序列信息,发现它们与相关亚历山大藻(A.affine)非常接近。分离于我国台湾地区的微小亚历山大藻(A.minutum)在序列上与分离自新西兰的藻株相似,而与分离自欧洲的微小亚历山大藻藻株相差较大。中国沿海亚历山大藻rDNA序列信息的获得为针对有毒藻种设计特异性核酸探针,发展灵敏快速的生物检测技术奠定了基础。  相似文献   

聚合酶链式反应在对虾病毒研究中的应用     

丁燏  郑莲 《海洋通报》2001,20(3):77-81

聚合酶链式反应是现代生物学领域一种非常重要的技术，本文介绍了这种技术在对虾病毒研究中的具体应用，包括病原检测、流行病学调查、寄生部位确定、同源性分析、DNA多态性分析、基因克隆与探针制备等。  相似文献   

刀额新对虾染色体核型及细胞核DNA含量   总被引：9，自引：0，他引：9  

张晓军  周岭华  相建海 《海洋与湖沼》2002,33(3):225-231

以刀额新对虾胚胎、无节幼体、卵巢、精巢等为材料 ,空气干燥法制备染色体 ,并初步进行核型分析。结果表明 ,刀额新对虾的染色体数目为 2n=78,n =39,核型为 2n=78=40M 1 0SM 1 4ST 1 4T。以刀额新对虾血淋巴、卵巢、肌肉、鳃为材料 ,以鸡血细胞为DNA标准 (2 50pg/ 2c) ,使用PartecCCAⅡ型流式细胞仪测定了刀额新对虾细胞的基因组DNA含量 ,其值为鸡血细胞的 1 75倍 ,绝对含量为 4 375pg/ 2c。  相似文献